آموزش مبانی اپیدمیولوژی ژنتیک - آخرین آپدیت

اپیدمیولوژی ژنتیک چیست؟ چشم‌انداز تاریخی و مقدمه What is Genetic Epidemiology? Historical Perspective and Introduction

• معرفی دوره Course Introduction

• معرفی ماژول ۱: اپیدمیولوژی ژنتیک چیست؟ Module 1 Introduction: What is Genetic Epidemiology?

• ریشه‌های اپیدمیولوژی ژنتیک Origins of Genetic Epidemiology

• میراث این ریشه‌ها و دقت علمی Legacies of these Origins and Scientific Rigor

• مدل‌های مسئولیت و آستانه: مقدمه Liability and Threshold Models: Introduction

• آزمون و یک مثال Testing and an Example

• تنظیم ژنتیکی بیان ژن Genetic Regulation of Gene Expression

• مقدمه Introduction

• روش‌ها Methods

• ادامه روش‌ها و توسعه Methods Continued and Extension

• پلیوتروپی (چند اثرت‌گری) Pleiotropy

مقدمه‌ای بر ژنتیک جمعیت: مدل‌ها و مفروضات Introduction to Population Genetics: Models and Assumptions

• مقدمه‌ای بر ژنتیک جمعیت Introduction to Population Genetics

• تعریف تعادل هاردی-واینبرگ و کاربردهای آن Hardy-Weinberg Equilibrium Definition and Implications

• آزمون HWE و مقادیر P-value HWE Testing and P-Values

• توان آزمون HWE، نمودارهای QQ و آزمون‌های متعدد HWE Testing Power, QQ Plots, and Multiple Tests

• انحرافات HW و ساختار جمعیت HW Departures and Population Structure

• رانش ژنتیکی ۱ Genetic Drift I

• رانش ژنتیکی ۲ Genetic Drift II

• ساختار جمعیت ۱ Population Structure I

• ساختار جمعیت ۲ Population Structure II

• هم‌خونی و خویشاوندی ۱ Inbreeding and Relatedness I

• هم‌خونی و خویشاوندی ۲ Inbreeding and Relatedness II

• هم‌خونی و خویشاوندی ۳ Inbreeding and Relatedness III

• ناهم‌تعادلی پیوستگی ۱ Linkage Disquilibrium I

• ناهم‌تعادلی پیوستگی ۲ Linkage Disquilibrium II

• ناهم‌تعادلی پیوستگی ۳ Linkage Disquilibrium III

• ناهم‌تعادلی پیوستگی ۴ Linkage Disquilibrium IV

ساختار جمعیت و مطالعات ارتباط ژنتیکی Population Structure and Genetic Association Studies

• ساختار جمعیت Population Structure

• تعریف ساختار جمعیت و بررسی اجمالی تاریخچه انسان Definition of Population Structure and Brief Overview of Human History

• عواملی که بر ساختار جمعیت و رانش ژنتیکی تاثیر می‌گذارند Factors the Influence Population Structure and Genetic Drift

• انتخاب طبیعی Natural Selection

• مثال‌هایی از ساختار جمعیت در انسان‌های مدرن Examples of Population Structure in Modern Humans

• مثال پیما (Pima) Pima Example

• روش‌های آماری ۱: ارتباط ساختاریافته و کنترل ژنومیک Statistical Methods I: Structured Association and Genomic Control

• روش‌های آماری ۲: تحلیل مؤلفه‌های اصلی (PCA) Statistical Methods II: Principal Components Analysis

• روش‌های آماری ۳: رگرسیون امتیاز LD Statistical Methods III: LD Score Regression

• روش‌های آماری ۴: مؤلفه‌های اصلی Statistical Methods IV: Principal Components

• روش‌های آماری ۵: مدل‌های مختلط Statistical Methods V: Mixed Models

• روش‌های آماری ۶: نقشه‌برداری آمیختگی Statistical Methods VI: Admixture Mapping

کنترل کیفیت پایه در داده‌های ژنتیکی: ساختار داده‌ها Basic Quality Control in Genetic Data: Data Structure

• کنترل کیفیت پایه در داده‌های ژنتیکی Basic Quality Control in Genetic Data

• انگیزه و پیش‌زمینه Motivation and Background

• مقدمه‌ای بر کنترل کیفیت Introduction to Quality Control

• نمودارهای QQ: بخش اول QQplots: Part 1

• نمودارهای QQ: بخش دوم QQplots: Part 2

• بررسی‌های ناسازگاری مندلی Mendelian Inconsistency Checks

• ساختار جمعیت: بخش اول Population Structure: Part 1

• ساختار جمعیت: بخش دوم Population Structure: Part 2

• تکمیل ژنوتیپ (Imputation): مقدمه Genotype Imputation: Introduction

• تکمیل ژنوتیپ: جزئیات، بخش اول Genotype Imputation: The Details, Part 1

• تکمیل ژنوتیپ: جزئیات، بخش دوم Genotype Imputation: The Details, Part 2

مطالعات ارتباطی مبتنی بر جمعیت Population-Based Association Studies

• مطالعات ارتباطی مبتنی بر جمعیت Population-Based Association Studies

• معیارهای پایه: بخش اول Basic Measures: Part 1

• معیارهای پایه: بخش دوم Basic Measures: Part 2

• استراتژی‌های رایج مدل‌سازی: بخش اول Common Modeling Strategies: Part 1

• استراتژی‌های رایج مدل‌سازی: بخش دوم Common Modeling Strategies: Part 2

• مقدمه‌ای بر آزمون‌های متعدد: بخش اول Introduction to Multiple Testing: Part 1

• مقدمه‌ای بر آزمون‌های متعدد: بخش دوم Introduction to Multiple Testing: Part 2

• تکرارپذیری: بخش اول Reproducibility: Part 1

• تکرارپذیری: بخش دوم Reproducibility: Part 2

• مقدمه‌ای بر تکمیل ژنوتیپ: بخش اول Introduction to Genotype Imputation: Part 1

• مقدمه‌ای بر تکمیل ژنوتیپ: بخش دوم Introduction to Genotype Imputation: Part 2

• مقدمه‌ای بر متاآنالیز و کنسرسیوم‌ها: بخش اول Introduction to Meta-Analysis and Consortia: Part 1

• مقدمه‌ای بر متاآنالیز و کنسرسیوم‌ها: بخش دوم Introduction to Meta-Analysis and Consortia: Part 2

• مقدمه‌ای بر متاآنالیز و کنسرسیوم‌ها: بخش سوم Introduction to Meta-Analysis and Consortia: Part 3

طراحی‌های مبتنی بر خانواده Family-Based Designs

• طراحی‌های مبتنی بر خانواده Family-Based Designs

• بررسی کلی Overview

• خوشه‌بندی خانوادگی Familial Clustering

• مطالعات دوقلوها Twin Studies

• سایر طراحی‌ها Other Designs

• روش‌های کلاسیک Classical Methods

• روش‌های مدرن Modern Methods

• مبانی بخش اول Basics Part 1

• مبانی بخش دوم Basics Part 2

• نوترکیبی و نقشه‌برداری Recombination and Mapping

• روش‌های پارامتریک Parametric Methods

• روش‌های بدون مدل (Model-Free) Model-Free Methods

• بررسی کلی بخش اول Overview Part 1

• بررسی کلی بخش دوم Overview Part 2

• انواع روش‌ها Types of Methods

• مرور کلی Overview

• پیوستگی (Linkage) Linkage

• ارتباط (Association) Association