آموزش مهندسی مدارهای ژنتیکی: طراحی - آخرین آپدیت

راهنمای مهندسان برای مدارهای ژنتیکی An Engineers Guide to Genetic Circuits

• زیست‌شناسی سیستم‌ها چیست؟ What is Systems Biology?

• مثال فاژ لاندا The Phage Lambda Example

• زیست‌شناسی سنتتیک چیست؟ What is Synthetic Biology?

• تاریخچه مختصری از زیست‌شناسی سنتتیک A Brief History of Synthetic Biology

• سلول‌ها و ویروس‌ها Cells and Viruses

• درشت‌مولکول‌ها Macromolecules

• ژنوم‌ها Genomes

• مدارهای ژنتیکی Genetic Circuits

قطعات ژنتیکی Genetic Parts

• هستی‌شناسی توالی (Sequence Ontology) Sequence Ontology

• بصری‌سازی SBOL SBOL Visual

• قطعات استاندارد Standard Parts

• مخازن داده‌ها Data Repositories

• استانداردهای FASTA و GenBank FASTA and GenBank Standards

• مروری بر مدل داده‌ای SBOL SBOL Data Model Overview

• جزئیات مدل داده‌ای SBOL SBOL Data Model Details

• عناصر پیشرفته مدل داده‌ای SBOL SBOL Data Model Advanced Elements

• تبدیل مجموعه داده‌های iGEM Conversion of iGEM dataset

• مقایسه استانداردهای داده Comparison of Data Standards

• پروموترها Promoters

• سایت‌های اپراتور Operator Sites

• سایت‌های اتصال ریبوزوم Ribosome Binding Sites

• مناطق کدکننده پروتئین Protein Coding Regions

• ترمیناتورها Terminators

• آموزش SynBioHub SynBioHub Tutorial

• آموزش Excel2SBOL Excel2SBOL Tutorial

دستگاه‌های ژنتیکی Genetic Devices

• قوانین پایه دستگاه‌ها Basic Rules of Devices

• انواع دستگاه‌ها Types of Devices

• گیت‌های منطقی بیولوژیکی Biological Logic Gates

• وارون‌ساز و نوسان‌ساز ژنتیکی Genetic Inverter and Oscillator

• گیت‌های منطقی بیولوژیکی پایه Basic Biological Logic Gates

• الق‌کننده شیمیایی و گیت‌های منطقی تک ژنی Chemical Inducer and One Gene Logic Gates

• مدارهای منطقی ترتیبی Sequential Logic Circuits

• سوئیچ تغییر وضعیت ژنتیکی Genetic Toggle Switch

• المان C مولر ژنتیکی Genetic Muller C-Element

• چالش‌های طراحی مدار ژنتیکی Genetic Circuit Design Challenges

• آموزش SBOLCanvas SBOLCanvas Tutorial

ساختارهای ژنتیکی Genetic Construction

• کلونینگ ژن و واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) Gene Cloning and Polymerase Chain Reaction

• وکتورها و پلازمیدها Vectors and Plasmids

• روش‌های اسمبل کردن DNA DNA Assembly methods

• اسمبل استاندارد BioBrick BioBrick Standard Assembly

• اسمبل Golden Gate Golden Gate Assembly

• روش‌های همولوژی انتهایی End Homology Methods

• سنتز DNA DNA Synthesis

اصول طراحی مدار ژنتیکی Principles of Genetic Circuit Design

• مقدمه Introduction

• حالت‌های شکست Failure Modes

• مسائل زمینه‌ای (Context Issues) Context Issues

• سبک‌های جایگزین در طراحی مدار ژنتیکی Alternative Genetic Circuit Design Styles

• مسیر پیش رو The Road Ahead