آموزش مقدمه ای بر شیمی انفورماتیک و شیمی دارویی
Introduction to Cheminformatics and medicinal chemistry
سلام! در این دوره قصد دارم مفاهیم و ابزارهای شیمی دارویی و شیمی انفورماتیک را معرفی کنم!
شیمی‌فورماتیک را می‌توان به عنوان یک رشته بین‌رشته‌ای درک کرد. این شامل دانش نظری شیمی و کاربرد انفورماتیک است. این حوزه در چندین زمینه مانند توسعه دارو، علوم محیطی و علم مواد کاربرد دارد. در این دوره، ما بر روی بخشی از شیمی‌فورماتیک به کار رفته در کشف دارو تمرکز می‌کنیم. در این دوره مقدماتی، دانشی در مورد پایگاه داده های شیمیایی، ترسیم ساختارهای مولکولی، و نرم افزارهایی برای تجزیه و تحلیل ویژگی های فیزیکوشیمیایی و ساختاری مولکول ها به منظور پیش بینی خواص فارماکوکینتیک، زیست فعالی یا مشخصات ایمنی آنها به دست خواهید آورد.
شیمی دارویی، از طرف دیگر، حوزه ای است که شیمی و فارماکولوژی در آن تلاقی می کنند و مستقیماً در فرآیند توسعه منطقی دارو دخالت دارد. تفاوت اصلی آن با فرآیند سنتی کشف دارو، تأکید بر خواص شیمیایی و ساختار ترکیبات شیمیایی است که برای ایجاد بینش‌های احتمالی در مورد فعالیت‌های بیولوژیکی آنها مورد بررسی قرار می‌گیرد. بنابراین، شیمی دارویی، منطق انتخاب مولکول‌ها، استنتاج خواص فارماکوکینتیک احتمالی آنها، مانند غلظت پلاسما، یا فعالیت بیولوژیکی، بر اساس گروه‌های عملکردی، وزن مولکولی، cLogP و غیره را فراهم می‌کند.
اگر علاقه مند به...
هستید، ممکن است این دوره را دوست داشته باشیددرک نحوه نمایش مولکول ها در یک فایل قالب خطی
آشنایی با نحوه استفاده از پایگاه های داده شیمیایی
دانستن از ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی که ممکن است به پیش‌بینی در دسترس بودن خوراکی نامزدهای دارو کمک کند
استفاده از نرم افزارهای رایگان برای تجزیه و تحلیل ساختار مولکول ها برای پیش بینی ویژگی های فیزیکوشیمیایی
استفاده از نرم افزارهای رایگان برای تجزیه و تحلیل ساختار مولکول ها برای پیش بینی فعالیت بیولوژیکی
آگاهی از ارتباط پروتئین‌ها با فرآیند کشف دارو
مشارکت در زمینه بیوشیمی و طراحی پروتئین با بازی Foldit
معرفی Introduction
-
نمای کلی دوره Course overview
-
شیمی انفورماتیک و شیمی دارویی Cheminformatics and medicinal chemistry
-
واحدهای فعالیت بیولوژیکی Units of biological activity
-
نمایش ساختارهای مولکولی به صورت SMILES The representation of molecular structures as SMILES
پایگاه های اطلاعاتی شیمیایی Chemical databases
-
پایگاه داده های شیمیایی: یک مرور کلی Chemical databases: an overview
-
PUBCHEM PUBCHEM
-
PUBCHEM Sketcher PUBCHEM Sketcher
-
پایگاه داده ZINC ZINC database
-
CHEMspider CHEMspider
-
ورزش Exercise
مفاهیم ADMET ADMET concepts
-
مقدمه ای بر مفاهیم ADME Intro to ADME concepts
-
توصیف کننده های فیزیکی و شیمیایی فراهمی زیستی Physico-chemical descriptors of bioavailability
-
نرم افزار تجزیه و تحلیل: Molinspiration Software of analysis: Molinspiration
-
نرم افزار تجزیه و تحلیل: SwissADMET Software of analysis: SwissADMET
-
نرم افزار تجزیه و تحلیل: Pro-Tox-II Software of analysis: Pro-Tox-II
-
ورزش Exercise
ساختار و فعالیت بیولوژیکی Structure and biological activity
-
معرفی بخش Introduction to the section
-
کتابخانه ترکیبی Combinatorial library
-
رویکرد مبتنی بر قطعه Fragment based approach
-
پپتیدومیمتیک ها Peptidomimetics
-
بیوسستریسم Biososterism
-
نرم افزار تجزیه و تحلیل: SwissBioisostere Software of analysis: SwissBioisostere
مطالعات با پروتئین Studies with proteins
-
مقدمه ای بر پروتئین ها Introduction to proteins
-
پایگاه داده PDB: قسمت 1 PDB database: part 1
-
پایگاه داده PDB: قسمت 2 PDB database: part 2
-
مطالعات اتصال مولکولی Molecular docking studies
-
اتصال مولکولی با SwissDock Molecular docking with SwissDock
-
مقدمه Foldit: قسمت 1 Introduction fo Foldit: part 1
-
مقدمه Foldit: قسمت 2 Introduction fo Foldit: part 2
-
ورزش Exercise
بخش پاداش Bonus section
-
سخنرانی پاداش Bonus lecture
-
هوش مصنوعی در کشف مواد مخدر Artificial intelligence in drug discovery
https://donyad.com/d/ed44f5
Guilherme Matos Passarini, phD
ProfessorEnglish: سلام، اسم من Guilherme است، لیسانس علوم زیستی، فوق لیسانس زیست شناسی تجربی و Ph.D. همچنین در زیست شناسی تجربی، هر دو از دانشگاه فدرال Rondonia (برزیل). حوزه اصلی تحقیق من جستجوی ترکیباتی است که علیه انگل های مالاریا و لیشمانیوز فعال هستند. من همچنین مدتی است که برنامه نویسی می کنم، به خصوص در زبان های برنامه نویسی Python و R. علایق اصلی من زیست شناسی، بیوتکنولوژی، برنامه نویسی، شیمی دارویی و هوش مصنوعی است. بنابراین هدف اصلی من در اینجا در Udemy گسترش دانش مربوط به این مناطق به مردم در سراسر جهان است. پرتغالی: Bacharel e licenciado em Ciências Biológicas pela Universidade Federal de Rondonia, mestre em Biologia Experimental pela Universidade Federal de Rondonia و Doutor Também em Biologia Experimental pela Universidade Federal de Rondonia. Desenvolveu seus trabalhos de iniciação científica e mestrado na busca de moléculas de plantas bioativas contra os parasitas da malária e leishmaniose، tendo trabalhado com fitoquímica and ensaios antiparasitários in vitro. بدون انجام نهایی، بیوانفورماتیک، داروهای دارویی و برنامه‌ریزی‌شده، برنامه‌های کاربردی آلگان‌های بیوانفورماتیک و کویمیوانفورماتیک برای کمک‌رسانی به ضد مالاریا در دسکوببرتا. تجربه‌ای را به‌عنوان زبان‌شناس پایتون و R، و برنامه‌نویسی با جاوا اسکریپت شروع کنید. Seu projeto de doutorado se constitui em avaliar um composto antimalárico já testado durante o mestrado de forma mais aprofundada contra o parasita da malária, realando análises virtuais, como verificação de características físico-quíae virtuale do parasita) e ensaios em placas de cultura.
نمایش نظرات