آموزش استادی در بیوانفورماتیک: ایمونوانفورماتیک - آخرین آپدیت

سرفصل ها و درس ها

طراحی واکسن و واکسن‌شناسی معکوس Vaccine Design and Reverse Vaccinology

• مقدمه‌ای بر ایمونولوژی Introduction to Immunology

• مقدمه‌ای بر طراحی واکسن و واکسن‌شناسی معکوس Introduction to Vaccine design and Reverse vaccinology

• مرور کلی دوره Course Overview

تحلیل عملکرد پروتئین‌های آنتی‌ژنیک Functional Analysis of Antigenic Proteins

• پیش‌بینی ساختار اولیه پروتئین آنتی‌ژنیک Primary protein structure prediction of antigenic protein

• پیش‌بینی آنتی‌ژنیسیته پروتئین‌های آنتی‌ژنیک Prediction of antigenicity of antigenic proteins

• پیش‌بینی ماهیت آلرژیک پروتئین‌های آنتی‌ژنیک Prediction of allergic nature of antigenic proteins

• پیش‌بینی خواص فیزیکوشیمیایی پروتئین‌های آنتی‌ژنیک Prediction of physiochemical properties of antigenic proteins

تحلیل ساختاری پروتئین‌های آنتی‌ژنیک Structural Analysis of Antigenic Proteins

• پیش‌بینی ساختار ثانویه پروتئین آنتی‌ژنیک Prediction of secondary structure of antigenic protein

• پیش‌بینی دامنه‌ها و نواحی مهم در پروتئین آنتی‌ژنیک Prediction of domains and important sites in antigenic protein

پیش‌بینی اپی‌توپ Epitope Prediction

• پیش‌بینی اپی‌توپ پیوسته سلول B Continuous B-cell epitope prediction

• پیش‌بینی اپی‌توپ ناپیوسته سلول B Discontinuous B-cell epitope prediction

• پیش‌بینی نواحی ایمونوژنیک در پروتئین آنتی‌ژنیک Prediction of immunogenic regions in antigenic protein

• پیش‌بینی اپی‌توپ‌های آنتی‌ژن گلیکوپروتئین Prediction of glycoprotein antigen epitopes

• پیش‌بینی اپی‌توپ سلول T سیتوتوکسیک Cytotoxic T cell epitope prediction

• پیش‌بینی MHC کلاس I و II MHC class I and II prediction

• پیش‌بینی پردازش اپی‌توپ‌های سلول T T cell epitopes processing prediction

• پیش‌بینی ایمونوژنیسیته اپی‌توپ‌های سلول T T cell epitopes Immunogenicity prediction

مدل‌سازی و داکینگ آنتی‌ژن و آنتی‌بادی Antigen and Antibody Modelling & Docking

• مدل‌سازی خودکار آنتی‌ژن Automated antigen modelling

• مدل‌سازی آنتی‌ژن مبتنی بر هم‌ترازی Alignment based antigen modelling

• مدل‌سازی آنتی‌بادی Antibody modelling

• داکینگ آنتی‌ژن-آنتی‌بادی Antigen-Antibody Docking

نتیجه‌گیری–طراحی واکسن و ایمونوانفورماتیک Conclusion-Vaccine Design and Immunoinformatics

• خلاصه Summary