آموزش تحلیل داده‌های Single-Cell RNA-Seq با R و پایتون - آخرین آپدیت

سرفصل ها و درس ها

شروع کار با فناوری تک‌سلولی (تئوری) Getting Started with Single Cell Technology (Theory)

• توالی‌یابی RNA تک‌سلولی (scRNA seq) چیست؟ What is Single-Cell RNA Sequencing (scRNA-seq)?

• از Bulk RNA Seq تا ترانسکریپتومیکس تک‌سلولی From Bulk RNA-Seq to Single-Cell Transcriptomics

• کاربردهای کلیدی scRNA seq در پژوهش و پزشکی Key Applications of scRNA-seq in Research and Medicine

• مروری بر خط‌لوله تحلیل Single Cell RNA Seq Overview of the Single-Cell RNA-Seq Analysis Pipeline

• شروع کار با فناوری تک‌سلولی Getting Started with Single Cell Technology

شروع کار با R و R Studio Getting Started with R and R-Studio

• مقدمه‌ای بر برنامه‌نویسی R برای بیوانفورماتیک Introduction to R Programming for Bioinformatics

• راه‌اندازی R و RStudio برای تحلیل scRNA seq Setting Up R and RStudio for scRNA-seq Analysis

• درک ساختارهای داده در R (وکتورها، لیست‌ها، دیتا فریم‌ها) Understanding Data Structures in R (Vectors, Lists, Data Frames)

• وارد کردن و خروجی گرفتن داده‌ها در R Importing and Exporting Data in R

• نصب و مدیریت پکیج‌های R Installing and Managing R Packages

• تکنیک‌های بصری‌سازی داده‌ها در R (ggplot2) Data Visualization Techniques in R (ggplot2)

تحلیل Single Cell RNA Seq در R Single-Cell RNA-Seq Analysis in R

• نصب کتابخانه‌های مورد نیاز برای scRNA seq در R Installing Required Libraries for scRNA-seq in R

• دانلود و بارگذاری مجموعه‌داده‌های Single Cell RNA seq Downloading and Loading Single-Cell RNA-seq Datasets

• کنترل کیفیت و نرمال‌سازی داده‌ها Quality Control and Data Normalization

• کاهش ابعاد، خوشه‌بندی و بصری‌سازی Dimensionality Reduction, Clustering, and Visualization

• شناسایی ژن‌های نشانگر و بیان تفاضلی Identifying Marker Genes and Differential Expression

• تحلیل Single Cell RNA Seq در R Single-Cell RNA-Seq Analysis in R

• بررسی ناهمگنی تومور با استفاده از داده‌های Single Cell RNA seq Characterizing Tumor Heterogeneity Using Single-Cell RNA-seq Data

تحلیل Single Cell RNA Seq در پایتون Single-Cell RNA-Seq Analysis in Python

• تحلیل Single Cell RNA Seq با استفاده از Scanpy Single-Cell RNA-Seq Analysis Using Scanpy

• تحلیل Single Cell RNA Seq در پایتون Single-Cell RNA-Seq Analysis in Python

ابزارهای scRNA Seq مبتنی بر GUI و ابری GUI and Cloud-Based scRNA-Seq Tools

• تحلیل داده‌های scRNA Seq با استفاده از پلتفرم‌های GUI و ابری Analyzing scRNA-Seq Data using GUI and Cloud Platforms