آموزش مدل‌سازی QSAR: اصول و کاربرد - آخرین آپدیت

آموزش مدل‌سازی QSAR در طراحی دارو به کمک کامپیوتر (CADD)

در این دوره، مدل‌سازی رابطه کمی ساختار-فعالیت (QSAR) در طراحی دارو به کمک کامپیوتر (CADD) را خواهید آموخت. مهارت‌های عملی برای توسعه مدل‌های QSAR کسب خواهید کرد، که یک ابزار ارزشمند و یک مکمل عالی برای مجموعه مهارت‌های شما خواهد بود. این دوره به ویژه برای متخصصان طراحی دارو، کموانفورماتیک، بیوانفورماتیک یا زمینه‌های مرتبط مفید است. این دوره همچنین مفاهیم کلیدی در یادگیری ماشین، که در توسعه مدل‌های QSAR نقش دارد را توضیح می‌دهد.

آنچه در این دوره QSAR خواهید آموخت:

• درک اصول مدل‌سازی QSAR در طراحی دارو
• مهارت‌های عملی در توسعه و اعتبارسنجی مدل‌های QSAR با استفاده از روش‌ها و تکنیک‌های مختلف
• برنامه‌ریزی، اجرا و گزارش‌دهی مطالعات QSAR برای انتشار یا پروژه‌ها
• انجام غربالگری مجازی با استفاده از مدل‌های QSAR
• بهبود مهارت‌ها و دانش طراحی دارو به کمک کامپیوتر (CADD) مانند برنامه‌ریزی و اجرای گردش کار

پیش‌نیازها:

دانش پایه در طراحی دارو یا هر زمینه مرتبط مانند شیمی دارویی یا بیوانفورماتیک مورد نیاز است.

توضیحات تکمیلی دوره QSAR:

در بخش‌های ابتدایی، جنبه‌های نظری مدل‌سازی QSAR توضیح داده می‌شود که شامل دانش شیمیایی و آماری مورد نیاز برای انجام QSAR است.

به دنبال بخش‌های نظری اولیه، بخش‌های عملی شامل انجام آزمایش‌های QSAR عملی با استفاده از مجموعه داده‌های QSAR واقعی خواهد بود. تمام مجموعه‌داده‌ها در اختیار شما قرار می‌گیرد تا بتوانید آزمایش‌ها را دنبال کنید. یک نرم‌افزار رایگان مدل‌سازی QSAR در طول دوره استفاده خواهد شد که مدرن و کارآمد برای تمام وظایف مورد نیاز است. در اولین آزمایش، هر مرحله در فرآیند مدل‌سازی QSAR به طور مفصل توضیح داده شده و انجام می‌شود. در آزمایش‌های بعدی، مفاهیم جدیدی از جمله استفاده از روش‌های انتخاب توصیفگر خودکار، استفاده از الگوریتم‌های رگرسیون غیرخطی و انجام غربالگری مجازی با مدل‌های QSAR معرفی می‌شوند. در این بخش‌های عملی، هر مفهوم ابتدا به صورت تئوری توضیح داده شده و سپس در یک آزمایش عملی نشان داده می‌شود. موضوعات آزمایش‌ها به شرح زیر است:

1. آزمایش 1: توسعه گام به گام یک مدل QSAR (روش MLR) به طور مفصل.
2. آزمایش 2: توسعه یک مدل QSAR با استفاده از اثر انگشت و روش PLS.
3. آزمایش 3: توسعه یک مدل QSAR با استفاده از یک روش غیرخطی (kNN).
4. آزمایش 4: توسعه یک مدل QSAR با روش‌های انتخاب خودکار توصیفگر.
5. آزمایش 5: انجام غربالگری مجازی روی یک پایگاه داده با استفاده از یک مدل QSAR.

در بخش پایانی، برنامه‌ریزی، اجرا و گزارش‌دهی مطالعات QSAR توضیح داده می‌شود، و دستورالعمل‌های کلی برای پیشبرد تحلیل QSAR و همچنین نکات کلی در مورد نحوه انتشار موفقیت‌آمیز یک مطالعه QSAR ارائه می‌شود. این امر دانش نظری و عملی به دست آمده قبلی را گرد هم می‌آورد تا دیدگاه و کارایی روشنی در انجام مطالعات QSAR به شما ارائه دهد. به طور کلی، هدف از این دوره توضیح موضوع QSAR و ارائه مهارت‌های عملی برای انجام مطالعات مدل‌سازی QSAR است.