آموزش بیوشیمی ساختاری (Structural Biochemistry) - آخرین آپدیت

سرفصل ها و درس ها

خوش‌آمدگویی به دنیای بیوشیمی ساختاری 欢迎进入结构生物化学世界（Welcome to the World of Structural Biochemistry）

• مقدمه‌ای بر بیوشیمی ساختاری 结构生物化学简介（Introduction to Structural Biochemsitry)

• روش‌های یادگیری بیوشیمی - سری اول 生物化学学习方法系列1

• روش‌های یادگیری بیوشیمی - سری دوم 生物化学学习方法系列2

فصل اول: ساختار و عملکرد پروتئین‌ها 第一章 蛋白质的结构与功能（Chapter 1 Structure and Function of Proteins)

• اسیدهای آمینه 氨基酸（Amino acids)

• اسیدهای آمینه پروتئین‌زا و غیرپروتئین‌زا 蛋白质氨基酸与非蛋白质氨基酸（ Proteinogenic AA & non-protenogenic AA）

• اسیدهای آمینه آب‌گریز و آب‌دوست 疏水氨基酸与亲水氨基酸（Hydrophobic & Hydrophilic AAs）

• اسیدهای آمینه ضروری و غیرضروری 必需氨基酸与非必需氨基酸（Essential & Non-essential AAs）

• نمادهای اختصاری ۲۲ اسید آمینه 氨基酸的英文缩写（Abbreviations for 22 amino acids）

• واکنش تراکمی اسیدهای آمینه 氨基酸的缩合反应（AA Condensation reaction）

• کایرالیته اسیدهای آمینه 氨基酸的手性（Chirality of Amino Acids）

• تفکیک اسیدی و بازی اسیدهای آمینه و pI 氨基酸的两性解离与等电点（Acid & base dissociation of amino acids and pI）

• واکنش با نینهیدرین 茚三酮反应（Reaction with Ninhydrin)

• واکنش سنگر (DNFB) Sanger反应（Reaction with DNFB）

• واکنش ادمن (PITC) Edman反应（Reaction with PITC）

• پروتئین‌ها 蛋白质（Proteins）

• ساختار اولیه پروتئین‌ها 蛋白质的一级结构（Primary Structure of Proteins）

• پیوندهای پپتیدی 肽键（Peptide bonds）

• ساختار ثانویه پروتئین‌ها 蛋白质的二级结构（Secondary Structure of Proteins）

• مارپیچ آلفا α螺旋（The Alpha Helix）

• صفحه بتا-پلیتد β折叠（The Beta-Pleated Sheet）

• پیچ بتا β转角（The Beta Turn）

• برجستگی بتا β突起（The Beta Bulge）

• ساختار ثالثیه پروتئین‌ها 蛋白质的三级结构（Tertiary structure of Proteins）

• برهم‌کنش‌های آب‌گریز 疏水键（Hydrophobic interactions）

• موتیف 模体（Motif）

• دومین 结构域（Domain）

• ساختار چهارم پروتئین‌ها 蛋白质的四级结构（Quaternary Structure of Proteins）

• تاخوردگی پروتئین 蛋白质的折叠（Protein folding）

• پروتئین‌های ذاتاً تاخورده‌نشده 天然无折叠蛋白（Natively Unfolded Proteins）

• آزمایش آنفینسن Anfinsen实验（Anfinsen’s Experiment）

• شپرون‌های مولکولی 分子伴侣（ Molecular Chaperone）

• پروتئین دی‌سولفید ایزومراز 蛋白质二硫化物异构酶（Protein disulfide isomerase）

• پپتیدیل‌پرولیل سیس-ترانس ایزومراز 脯氨酰肽酰顺反异构酶（Peptidylprolyl cis-trans isomerase）

• پریون‌ها 朊病毒（Prions）

• پروتئوم 蛋白质组（Proteome）

• عملکردهای پروتئین‌ها Functions of Proteins

• پروتئین‌های چندمنظوره 兼职蛋白（Moonlighting Proteins）

• رابطه بین ساختار و عملکرد پروتئین‌ها 蛋白质结构与功能之间的关系（Structure and function relationships of proteins）

• آلفا کراتین α角蛋白（Alpha Keratin）

• بتا کراتین β角蛋白（Beta Keratin）

• کلاژن 胶原蛋白（Collagen）

• میوگلوبین و هموگلوبین 肌红蛋白与血红蛋白（Myoglobin & Hemoglobin）

• تعاونی مثبت 正协同效应（1.40 Positive Cooperativity）

• اثر بور 波尔效应（Bohr Effect）

• اثر آلوستریک 别构效应（Allosteric effect）

• HbS HbS

• HbF HbF

فصل دوم: ساختار و عملکرد اسیدهای نوکلئیک 第二章 核酸的结构与功能（Chapter 2 Structure and Function of Nucleic Acids)

• بازها 碱基（Bases）

• توتومریزم کتو-انول 互变异构（Keto-enol tautomerism）

• نوکلئوزیدها 核苷（Nucleosides）

• نوکلئوتیدها 核苷酸（Nucleotides）

• اسیدهای نوکلئیک 核酸（Nucleic Acids）

• RNAهای چندمنظوره 多种多样的RNA（Versatile RNAs）

• ساختار اولیه اسیدهای نوکلئیک 核酸的一级结构（Primary Structure of Nucleic Acids）

• B-DNA B-DNA

• A-DNA A-DNA

• Z-DNA Z-DNA

• سایر اشکال ساختار ثانویه DNA 几种DNA非常规的二级结构（Other forms of secondary structure of DNA）

• ساختار ثانویه RNA RNA二级结构（Secondary Structure of RNA）

• ساختار ثالثیه DNA DNA三级结构（Tertiary Structure of DNA）

• ساختار ثالثیه RNA RNA三级结构（Tertiary Structure of RNA）

• کمپلکس RNA-پروتئین 核糖核酸蛋白复合物（RNA-Protein Complex）

• نوکلئوزوم 核小体（Nucleosome）

• فرضیه دنیای RNA RNA世界（The RNA world hypothesis）

فصل سوم: ویژگی‌های پروتئین‌ها و اسیدهای نوکلئیک 第三章 蛋白质和核酸的性质（Chapter 3 Properties of Proteins and Nucleic Acids)

• جذب UV 紫外吸收（UV absorption）

• رسوب 沉淀（Precipitation）

• تفکیک اسیدی و بازی و pI 两性解离（Acid & base dissociation and pI）

• دناتوراسیون 变性（Denaturation）

• رناتوراسیون 复性（Renaturation）

• Tm Tm

• هیدرولیز 水解（Hydrolysis）

• واکنش‌های رنگی پروتئین 蛋白质的颜色反应（Protein coloring reaction)

• الکتروفورز 电泳（Electrophoresis）

• کروماتوگرافی 层析（Chromatography）

• دیالیز و اولترافیلتراسیون 透析与超滤（Dialysis and Ultrafiltration）

فصل چهارم: ساختار و عملکرد آنزیم‌ها 第四章 酶的结构与功能（Chapter 4 Structure and Function of Enzymes)

• آنزیم‌ها 酶（Enzymes）

• کوفاکتورها 辅助因子（Cofactors)

• ریبوزیم‌ها 核酶（Ribozymes）

• سایت فعال 活性中心（The Active Site）

• مدل قفل و کلید “锁与钥匙”模型（The Lock and Key Model）

• مدل تناسب القایی “诱导契合”模型（The Induced Fit Model）

• مدل اتصال سه نقطه‌ای “三点附着”模型（The Three-point Attachment Model）

• نام‌گذاری آنزیم‌ها 酶的命名和分类（Enzyme Nomenclature）

• سینتیک آنزیمی 酶动力学（Enzyme Kinetics）

• معادله مایکلیس-منتن 米氏方程（The Mechaelis-Menten Equation）

• kcat و kcat/Km kcat和kcat/Km（kcat & kcat/Km）

• نمودار دو-معکوس 双倒数作图（The Double-Reciprocal Plot）

• مهارکننده‌های آنزیمی 酶抑制剂（Enzyme Inhibitors）

• مهارکننده رقابتی 竞争性抑制剂（Competitive Inhibitor）

• مهارکننده غیررقابتی 非竞争性抑制剂（Non-competitive Inhibitor）

• مهارکننده غیررقابتی (Uncompetitive) 反竞争性抑制剂（Uncompetitive Inhibitor）

• واکنش‌گرهای اختصاصی گروه 基团特异性抑制剂（Group Specific Reagent）

• آنالوگ‌های سوبسترا 底物类似物（Substrate Analogue）

• مهارکننده انتحاری 自杀性抑制剂（Suicide Inhibitor）

• آنزیم‌های آلوستریک 别构酶（Allosteric Enzymes）

• مدل هماهنگ 齐变模型（The Concerted Model）

• مدل متوالی 序变模型（The Sequential Model）

• تئوری تثبیت حالت گذار 过渡态稳定学说（The Transition-State Stabilization Theory）

• ابزیم‌ها (Abzymes) 抗体酶（Abzymes）

• کاتالیز از طریق مجاورت و جهت‌گیری 临近与定向效应（Catalysis by Proximity and Orientation）

• کاتالیز عمومی اسید-باز 广义酸碱催化（General Acid-Base Catalysis）

• کاتالیز الکترواستاتیک 静电催化（Electrostatic Catalysis）

• کاتالیز فلزی 金属催化（Metal Catalysis）

• کاتالیز کووالانسی 共价催化（Covalent Catalysis）

• کرنش سوبسترا 底物形变（Substrate Strain）

• پروتئازها 蛋白酶（Proteases）

• تنظیم فعالیت‌های آنزیمی 酶活性的调节（Regulation of Enzyme Activities)

• ایزوآنزیم‌ها 同工酶（Isozymes

• کنترل آلوستریک 别构调节（Allosteric Control）

• تنظیم توسط تغییرات کووالانسی 共价修饰调节（Regulation by Covalent Modif

• فعال‌سازی پروتئولیتیک 水解激活（Proteolytic Activation）

• تحریک و مهار توسط پروتئین‌های کنترلی 调节蛋白的激活和抑制（Stimulation and Inhibition by Control Proteins）

• ویتامین‌ها 维生素（Vitamins）

فصل پنجم: ساختار و عملکرد کربوهیدرات‌ها و لیپیدها 第五章 糖类和脂类的结构与功能（Chapter 5 Structure and Function of Carbohydrates and Lipids)

• کربوهیدرات‌ها 碳水化合物（Carbohydrates）

• مونوساکاریدها 单糖（Monosaccharides）

• اپیمرها 差向异构体（Epimers）

• آنومرها 异头体（Anomer）

• الیگوساکاریدها 寡糖（Oligosaccharides）

• پلی‌ساکاریدها 多糖（Polysaccharides）

• گلیکوکونژوگه‌ها 糖缀化合物（Glycoconjugates）

• لیپیدها 脂类（Lipids）

• اسیدهای چرب 脂肪酸（Fatty Acids）

• چربی‌ها 脂肪（Fats）

• چربی‌های ترانس 反式脂肪（Trans Fats）

• فسفولیپیدها 磷脂（Phospholipids）

• کلسترول 胆固醇（Cholesterol）

• دولایه‌های لیپیدی 脂双层（Lipid Bilayers）

فصل ششم: ساختار و عملکرد هورمون‌ها 第六章 激素的结构与功能（Chapter 6 Structure and Function of Hormones)

• هورمون‌ها 激素（Hormones）

• رادیوایمنومنی 放射免疫测定（Radioimmnoessay）

• گیرنده‌ها 受体（Receptors）

• پیام‌رسان‌های ثانویه 第二信使（Second Messengers）

• پروتئین‌های G G蛋白（G-proteins）

• پروتئین کینازها 蛋白质激酶（Protein Kinases）

• مکانیسم عمل هورمون‌ها از طریق گیرنده‌های داخل‌سلولی 通过胞内受体的激素作用机制（Mechanism of Hormone Action by Intracellular Receptors）

• سیستم PKA PKA系统（The PKA System）

• سیستم PKC PKC系统（The PKC System）

• سیستم PKG PKG系统（The PKG System）

• سیستم اکسید نیتریک NO系统（Nitric Oxide System）

• سیستم گیرنده تیروزین کیناز (RTK) 受体酪氨酸激酶系统（The RTK System）

• انتقال سیگنال‌های بینایی 视觉产生相关的信号转导（Visual Signal Transduction）

• انتقال سیگنال‌های بویایی 嗅觉产生相关的信号转导（Olfactory Signal Transduction）

• خاتمه سیگنال 信号系统的终止（Termination of the Signal）

جمع‌بندی، امتحان نهایی و سپاسگزاری 结语、鸣谢与学期考试（Final Exam, Concluding Remarks and Acknowledgments）