آموزش زیست‌شناسی شیمیایی (Chemical Biology) - آخرین آپدیت

مقدمه‌ای بر زیست‌شناسی شیمیایی: مفاهیم و تکنیک‌ها Welcome to Chemical Biology: Concepts and techniques

• تریلر معرفی دوره Trailer

• خوش‌آمدگویی Welcome

• چرا زیست‌شناسی شیمیایی را مطالعه کنیم؟ Why study chemical biology?

• سرفصل‌ها و نکات برجسته دوره Course outline and highlights

• واحدهای سازنده: واحدهای مونومری پروتئین‌ها The building blocks: monomeric units of proteins

• واحدهای سازنده: واحدهای مونومری DNA و غشاها The building blocks: monomeric units of DNA and membranes

• پیام‌رسان‌ها و پیام‌ها: تغییرات پس از ترجمه و مسیرها Messengers and messages: posttranslational modifications, and pathways

• مطالعه فرآیندهای سلولی با زیست‌شناسی شیمیایی در زمان واقعی Studying cellular processes with chemical biology in real time

جزئیات ریز، کلید موفقیت The Devil is in the Minutest Detail

• خوش‌آمدگویی به ماژول ۲ Welcome to Module 2

• روشن کردن نور! فلوروفورها: ساختارها و اصول فلورسانس Light'em up! Fluorophores: structures, and fluorescent principles

• بهره‌وری خروجی نسبت به ورودی Get out (almost) what you put in!

• میکروسکوپی نوری سنتی – کاربردها Traditional light microscopy – applications

• میکروسکوپی نوری سنتی – نکات احتیاطی Traditional light microscopy – precautions

خط‌کشی زمان و مکان! سنجش‌های فلورسانس برای اندازه‌گیری پارامترهای پیچیده در زمان واقعی A ruler over time and space! Fluorescent assays to measure complex parameters in real time

• خوش‌آمدگویی به ماژول ۳ Welcome to Module 3

• ایجاد کروماتین اصلاح‌شده Creating modified chromatin

• کمپلکس PRC2، یک کمپلکس متصل به DNA مرتبط با رشد و سرطان PRC2, a DNA binding complex linked to development and cancer

• بحث درباره TIRF TIRF talk

• کار با سیستم TIRF ما On our TIRF

• استفاده از TIRF برای مطالعه پروتئین‌های متحرک روی DNA If your protein surfs on DNA, hit the TIRF to study it

• نقش PHF1 در پایداری کمپلکس PRC2 و ارتقای فعالیت آن PHF1 Prolongs the stable PRC2-DNA complex, promoting activity

• مدل موزائیک سیال Fluid mosaic model

• اندازه‌گیری کشش غشا: روش‌های جدید Don’t get uptight! New methods to measure membrane tension

• تسلط بر اندازه‌گیری‌های کشش غشا Getting a grip on membrane tension measurements

• پروتئین‌های TOR: چهره‌های مختلف TORCing TORC: the many faces of the TOR proteins

• مسیرهای حسگر و بازیابی کشش غشا TORCing it out: pathways that seek to sense and restore membrane tension

به‌کارگیری پروتئین‌ها در خدمت ما Putting proteins to work for us

• خوش‌آمدگویی به ماژول ۴ Welcome to Module 4

• ردیابی یک پروتئین خاص در سلول‌های زنده و در زمان واقعی Tracking a specific protein in live cells & in real time

• کدهای پستی مولکولی (Molecular Zipcodes) Molecular zipcodes

• نحوه طراحی پروتئین ادغامی شما How to design your fusion protein

• اصول طراحی و بهینه‌سازی SNIFITs Design principle and optimization of SNIFITs

• استفاده از SNIFITs برای شناسایی انتقال‌دهنده‌های عصبی و داروها SNIFITs to ID neurotransmitters and drugs

• کاربرد در تشخیص‌های بالینی سریع (Point of Care) Application to point of care diagnosis

• الکتروفیل‌های بیولوژیکی: واکنش سلول به استرس Biological electrophiles, the cell’s way of saying “I’m stressed”?

• بررسی گسستن پیوندهای اتصال Breaking the tether is not that bad

• سیستم T REX: مسئله کنترل T-REX: a question of control(s)

• بازطراحی فعالیت کیناز از طریق هدف قرار دادن AKT و PTEN T-REX rewiring of kinase activity through targeting AKT and PTEN: opposing forces meet

اجرای عملی در مقیاس‌های بزرگتر Making light work of it on a larger and larger scale

• خوش‌آمدگویی به ماژول ۵ Welcome to Module 5

• پروتئین‌های متصل‌شونده و انتقال‌دهنده لیپیدها A fat lot of use? Proteins that bind and transport lipids

• تسهیل کشف اینتراکتوم‌های جدید Greasing the wheels of discovery for new interactomes

• لیپیدهای هدایت شده با لیزر Laser guided lipids

• برچسب‌گذاری دوتریوم برای بررسی متابولیسم اسفینگوزین در لیزوزوم‌ها Deuterium labeling to assess how sphingosine originating in lysosomes is metabolized

• ترکیب برچسب‌گذاری دوتریوم و ناک‌اوت (Knockout) Deuterium labeling and knockout combined

• بررسی سیگنالینگ کلسیم در اثر رهاسازی اسفینگوزین Mitochondria-released sphingosine does not elicit calcium signaling: global sphingosine release does

• روش G REX برای رهاسازی الکتروفیل‌های خاص بر اساس نیاز G-REX – a method to release specific electrophiles on demand

• شناسایی پروتئین‌های سیگنالینگ جدید در ماهی‌ها با G REX G-REX identifies important novel signaling proteins that function in fish

گسترش دامنه جستجو و غربالگری Casting wide your net

• خوش‌آمدگویی به ماژول ۶ Welcome to Module 6

• اسید نوکلئیک پپتیدی (PNA) – کاربرد در سنتز کتابخانه و روش split and mix Peptide Nucleic Acid – Use in library synthesis and split and mix approach

• در آزمایشگاه: خلاصه روش split and mix In the lab - split and mix approach in a nutshell

• نمایش توانمندی کتابخانه‌های PNA PNA libraries show their MITE

• تنوع‌بخشی به کتابخانه از طریق نمایش DNA It takes two: library diversification through DNA display

• عملیات STING: مهار پروتئین‌های مرتبط با بیماری‌های التهابی A STING operation: inhibiting a protein implicated in numerous inflammatory diseases

• اجرای غربالگری Performing the Screen

• جهش‌زایی: اطمینان از قرارگیری در هدف Mutagenesis: ensuring we stay on target