آموزش مدل‌های داده‌های بالینی و ارزیابی کیفیت داده‌ها - آخرین آپدیت

مقدمه: مدل‌های داده‌های بالینی و مدل‌های داده مشترک Introduction: Clinical Data Models and Common Data Models

• خوش‌آمدگویی به دوره مدل‌های داده‌های بالینی و ارزیابی کیفیت داده‌ها Welcome to Clinical Data Models and Data Quality Assessments

• انبار داده‌های تحقیقات بالینی Clinical Research Data Warehouses

• نمودارهای رابطه موجودیت (ERDs) Entity Relationship Diagrams (ERDs)

• مدل‌های داده‌های بالینی Clinical Data Models

• چرا مدل‌های داده مشترک؟ Why Common Data Models?

• مروری سریع بر مدل داده مشترک: i2b2 A Quick Tour of a Common Data Model: i2b2

• مروری سریع بر مدل داده مشترک: OMOP A Quick Tour of a Common Data Model: OMOP

• مروری سریع بر مدل داده مشترک: Sentinel A Quick Tour of a Common Data Model: Sentinel

• مروری سریع بر مدل داده مشترک: PCORNet A Quick Tour of a Common Data Model: PCORNet

ابزارها: استعلام از مدل‌های داده‌های بالینی Tools: Querying Clinical Data Models

• بررسی عمیق مدل داده MIMIC III A Deep Dive into the MIMIC-III Data Model

• نوشتن استعلام برای MIMIC III Querying MIMIC-III

• بررسی عمیق مدل داده OMOP A Deep Dive into OMOP Data Model

• نوشتن استعلام برای OMOP Querying OMOP

• مقایسه مدل‌های داده MIMIC و OMOP Comparing the MIMIC and OMOP Data Models

• اکوسیستم جامعه OHDSI The OHDSI Community Ecosystem

تکنیک‌ها: استخراج، تبدیل، بارگذاری (ETL) و نگاشت اصطلاحات Techniques: Extract-Transform-Load and Terminology Mapping

• وظایف فرآیند ETL The ETL Task

• نگاشت ساختاری در مقابل نگاشت اصطلاحات Structural versus Terminology Mapping

• پروفایل‌بندی داده‌ها با White Rabbit Data Profiling with White Rabbit

• نگاشت داده‌ها با ابزار Rabbit in a Hat Data Mapping with the Rabbit in a Hat Tool

• نگاشت اصطلاحات (Terminology Mapping) Terminology Mapping

• مثال نگاشت بیمار MIMIC به شخص در OMOP Example mapping of MIMIC Patient to OMOP Person

تکنیک‌ها: ارزیابی کیفیت داده‌ها Techniques: Data Quality Assessments

• ابعاد کیفیت داده‌ها / تناسب برای استفاده Data quality dimensions / fitness for use

• پروفایل‌بندی داده‌ها برای ارزیابی کیفیت Data profiling for data quality assessment

• ارزیابی کیفیت داده‌ها با استفاده از SQL Data quality assessment using SQL

• قوانین Callahan و Khare Callahan and Khare rules

• ابزارهای OHDSI Achilles و Achilles Heel OHDSI Achilles and Achilles Heel

کاربرد عملی: ایجاد فرآیند ETL برای تبدیل جدول MIMIC III به OMOP Practical Application: Create an ETL Process to Transform a MIMIC-III Table to OMOP

• مرور فرآیند ETL Review of the ETL process

• مثال: تبدیل بیمار MIMIC به شخص OMOP - مراحل ۱ و ۲ Example: Transforming MIMIC Patient to OMOP Person Steps 1 and 2

• مثال: تبدیل بیمار MIMIC به شخص OMOP - مرحله ۳ Example: Transforming MIMIC Patient to OMOP Person Step3

• مثال: تبدیل بیمار MIMIC به شخص OMOP - مرحله ۴ Example: Transforming MIMIC Patient to OMOP Person Step 4

• مثال: تبدیل بیمار MIMIC به شخص OMOP - مراحل ۵ و ۶ Example: Transforming MIMIC Patient to OMOP Person Steps 5 and 6

• مثال: تبدیل بیمار MIMIC به شخص OMOP - مرحله ۷ Example: Transforming MIMIC Patient to OMOP Person Step 7