آموزش علم داده‌های کلان با مرکز هماهنگی و یکپارچه‌سازی داده‌های BD2K-LINCS - آخرین آپدیت

مروری بر برنامه کتابخانه امضاهای سلولی مبتنی بر شبکه یکپارچه (LINCS) The Library of Integrated Network-based Cellular Signatures (LINCS) Program Overview

• لایه‌های تنظیم سلولی و فناوری‌های اومیکس Layers of Cellular Regulation and Omics Technologies

• نقشه اتصال (Connectivity Map) The Connectivity Map

• نمای هندسی مفهوم نقشه اتصال Geometrical View of the Connectivity Map Concept

• مراکز تولید داده و امضای LINCS LINCS Data and Signature Generation Centers

• مرکز هماهنگی و یکپارچه‌سازی داده‌های BD2K LINCS BD2K-LINCS Data Coordination and Integration Center

• سلول‌های بنیادی پرتوان القایی (iPSCs) Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs)

• آشنایی با داده‌های LINCS L1000 Introduction to LINCS L1000 Data

• دموی موتور جستجوی امضای جهت مشخصه L1000 (L1000CDS2) L1000 Characteristic Direction Signature Search Engine (L1000CDS2) Demo

متادیتا و هستی‌شناسی‌ها Metadata and Ontologies

• مقدمه‌ای بر متادیتا و هستی‌شناسی‌ها | بخش اول Introduction to Metadata and Ontologies | Part 1

• مقدمه‌ای بر متادیتا و هستی‌شناسی‌ها | بخش دوم Introduction to Metadata and Ontologies | Part 2

ارائه داده‌ها با استفاده از APIها Serving Data with APIs

• دسترسی و ارائه داده‌ها از طریق RESTful APIها | بخش اول Accessing and Serving Data through RESTful APIs | Part 1

• دسترسی و ارائه داده‌ها از طریق RESTful APIها | بخش دوم Accessing and Serving Data through RESTful APIs | Part 2

پایپ‌لاین‌های بیوانفورماتیک Bioinformatics Pipelines

• تحلیل داده‌های کلان با پایپ‌لاین‌های محاسباتی Analyzing Big Data with Computational Pipelines

هارمونیزوم (The Harmonizome) The Harmonizome

• مفهوم هارمونیزوم The Harmonizome Concept

• پردازش مجموعه‌داده‌ها | بخش اول Processing Datasets | Part 1

• پردازش مجموعه‌داده‌ها | بخش دوم Processing Datasets | Part 2

• پردازش مجموعه‌داده‌ها | بخش سوم Processing Datasets | Part 3

نرمال‌سازی داده‌ها Data Normalization

• نرمال‌سازی داده‌ها | بخش اول Data Normalization | Part 1

• نرمال‌سازی داده‌ها | بخش دوم Data Normalization | Part 2

خوشه‌بندی داده‌ها Data Clustering

• خوشه‌بندی داده‌ها | بخش اول | مقدمه Data Clustering | Part 1 | Introduction

• خوشه‌بندی داده‌ها | بخش دوم | توابع فاصله Data Clustering | Part 2 | Distance Functions

• خوشه‌بندی داده‌ها | بخش سوم | الگوریتم‌ها و ارزیابی Data Clustering | Part 3 | Algorithms and Evaluation

امتحان میان‌ترم Midterm Exam

تحلیل غنی‌سازی Enrichment Analysis

• تحلیل غنی‌سازی | بخش اول Enrichment Analysis | Part 1

• تحلیل غنی‌سازی | بخش دوم Enrichment Analysis | Part 2

• دموی Enrichr Enrichr Demo

یادگیری ماشین Machine Learning

• مقدمه‌ای بر یادگیری ماشین | بخش اول Introduction to Machine Learning | Part 1

• مقدمه‌ای بر یادگیری ماشین | بخش دوم Introduction to Machine Learning | Part 2

• مقدمه‌ای بر یادگیری ماشین | بخش سوم Introduction to Machine Learning | Part 3

بنچ‌مارکینگ (ارزیابی معیار) Benchmarking

• بنچ‌مارکینگ | بخش اول Benchmarking | Part 1

• بنچ‌مارکینگ | بخش دوم Benchmarking | Part 2

بصری‌سازی تعاملی داده‌ها Interactive Data Visualization

• بصری‌سازی تعاملی داده‌ها با E Charts Interactive Data Visualization with E-Charts

• بصری‌سازی داده‌ها با استفاده از کلاسترگرام‌های تعاملی ساخته شده با D3.js | بخش اول Visualizing Data using Interactive Clustergrams Built with D3.js | Part 1

• بصری‌سازی داده‌ها با استفاده از کلاسترگرام‌های تعاملی ساخته شده با D3.js | بخش دوم Visualizing Data using Interactive Clustergrams Built with D3.js | Part 2

• بصری‌سازی داده‌ها با استفاده از کلاسترگرام‌های تعاملی ساخته شده با D3.js | بخش سوم Visualizing Data using Interactive Clustergrams Built with D3.js | Part 3

پروژه‌های crowdsourcing Crowdsourcing Projects

• ریز-وظایف و دموی GEO2Enrichr Microtasks and GEO2Enrichr Demo

• چالش مگاتسک L1000 2 P100 L1000-2-P100 Megatask Challenge

امتحان نهایی Final Exam