آموزش کنترل اپی‌ژنتیک بیان ژن - آخرین آپدیت

تعریف کنترل اپی‌ژنتیک و اهمیت آن Definition of Epigenetic Control and its Importance

• مرور کلی دوره Course overview

• 1.1 مقدمه‌ای بر مفاهیم کنترل اپی‌ژنتیک 1.1 Introduction to the concepts of epigenetic control

• 1.2 وراثت میتوزی نشانه‌های اپی‌ژنتیک 1.2 Mitotic heritability of epigenetic marks

• 1.3 کروماتین و نوکلئوزوم 1.3 Chromatin and the nucleosome

• 1.4 تراکم کروماتین: هتروکروماتین در مقابل یوکروماتین 1.4 Chromatin compaction - heterochromatin versus euchromatin

• 1.5 متیلاسیون DNA در جزایر CpG 1.5 DNA methylation at CpG islands

• 1.6 متیلاسیون DNA در نواحی بین ژنی و عناصر تکراری 1.6 DNA methylation at intergenic regions and repetitive elements

تغییرات اپی‌ژنتیکی و سازماندهی هسته Epigenetic Modifications and Organisation of the Nucleus

• 2.1 مقدمه‌ای بر تغییرات دم هیستونی 2.1 Introduction to histone tail modifications

• 2.2 استیلاسیون هیستونی و متیلاسیون هیستونی 2.2 Histone acetylation and histone methylation

• 2.3 بازسازی کروماتین 2.3 Chromatin remodelling

• 2.4 واریانت‌های هیستونی 2.4 Histone variants

• 2.5 RNAهای غیرکدکننده: microRNAها 2.5 Noncoding RNAs - microRNAs

• 2.6 RNAهای غیرکدکننده: piRNAها 2.6 Noncoding RNAs - piRNAs

• 2.7 RNAهای غیرکدکننده: مقدمه‌ای بر lncRNAها 2.7 Noncoding RNAs - long noncoding RNAs introduction

• 2.8 RNAهای غیرکدکننده بلند Xist و HOTAIR 2.8 Long noncoding RNAs Xist and HOTAIR

• 2.9 سازماندهی سه‌بعدی هسته و خلاصه نشانه‌های اپی‌ژنتیک 2.9 3D organisation of the nucleus and summary of epigenetic marks

جبران دوز ژنی Dosage Compensation

• 3.1 تاریخچه و پیش‌زمینه غیرفعال‌سازی کروموزوم X 3.1 History and background of X chromosome inactivation

• 3.2 زمان‌بندی غیرفعال‌سازی تصادفی و اثرگذاری شده کروموزوم X 3.2 Timing of random and imprinted X chromosome inactivation

• 3.3 مراحل غیرفعال‌سازی X: شمارش و کنترل بیان Xist 3.3 Stages of X inactivation - counting and control of Xist expression

• 3.4 کنترل بیان Xist توسط فاکتورهای پلوری‌پوتنسی 3.4 Control of Xist expression by pluripotency factors

• 3.5 مراحل غیرفعال‌سازی X: انتخاب اینکه کدام X غیرفعال شود 3.5 Stages of X inactivation - choice of which X to inactivate

• 3.6 مراحل غیرفعال‌سازی X: شروع و گسترش خاموشی 3.6 Stages of X inactivation - initiation and spreading of silencing

• 3.7 مراحل غیرفعال‌سازی X: تثبیت خاموشی 3.7 Stages of X inactivation - establishment of silencing

• 3.8 مراحل غیرفعال‌سازی X: حفظ خاموشی (مثلاً Dnmt1) 3.8 Stages of X inactivation - maintenance of silencing e.g. Dnmt1

• 3.9 مراحل غیرفعال‌سازی X: حفظ خاموشی (مثلاً Smchd1) 3.9 Stages of X inactivation - maintenance of silencing e.g. Smchd1

• 3.10 خلاصه غیرفعال‌سازی کروموزوم X 3.10 X chromosome inactivation summary

• 3.11 جبران دوز ژنی در مگس‌ها و کرم‌ها در مقایسه با پستانداران 3.11 Dosage compensation in flies and worms, compared with mammals

• 3.12 درس‌هایی از مگس: تغییر رنگ اثر موقعیتی و غربالگری اصلاح‌کننده‌های اپی‌ژنتیک 3.12 Lessons from the fly - position effect variegation and screening for epigenetic modifiers

اثرگذاری ژنومی و برنامه‌ریزی مجدد اپی‌ژنتیک Genomic Imprinting and Epigenetic Reprogramming

• 4.1 مقدمه‌ای بر برنامه‌ریزی مجدد اپی‌ژنتیک ژنوم‌های مادری و پدری 4.1 Introduction to epigenetic reprogramming of the maternal and paternal genomes

• 4.2 برنامه‌ریزی مجدد اپی‌ژنتیک ژن‌های اثرگذاری شده و عناصر تکراری 4.2 Epigenetic reprogramming of imprinted genes and repetitive elements

• 4.3 مکان ژن‌های اثرگذاری شده در ژنوم و توالی‌یابی بیسولفیت 4.3 Location of imprinted genes in the genome and bisulfite sequencing

• 4.4 مکانیسم‌های اثر Kcnq1 و H19/Igf2 ICR و سندرم بک‌ویث-ویدمان 4.4 Kcnq1 and H19/Igf2 ICR mechanisms of action and Beckwith Weidemann syndrome

• 4.5 مکانیسم Snrpn ICR، سندرم‌های پرادر-ویلی و آنجلمن 4.5 Snrpn ICR mechanism, Prader Willi and Angelman syndromes

• 4.6 خلاصه برنامه‌ریزی مجدد اپی‌ژنتیک و اثرگذاری ژنی 4.6 Summary of epigenetic reprogramming and imprinting

تأثیر محیط بر کنترل اپی‌ژنتیک The Influence of the Environment on Epigenetic Control

• 5.1 اختلال در برنامه‌ریزی مجدد اپی‌ژنتیک در فناوری‌های کمک‌باروری 5.1 Disrupted epigenetic reprogramming in assisted reproductive technologies

• 5.2 اختلال در برنامه‌ریزی مجدد اپی‌ژنتیک در برنامه‌ریزی مجدد سلول‌های سوماتیک و کلونینگ 5.2 Disrupted epigenetic reprogramming in somatic cell reprogramming and cloning

• 5.3 مقدمه‌ای بر وراثت اپی‌ژنتیکی بین نسلی، اثرات محیط و دوره‌های حساس در کنترل اپی‌ژنتیک 5.3 Introduction of transgenerational epigenetic inheritance, effects of the environment and sensitive periods in epigenetic control

• 5.4 مطالعات اپیدمیولوژیک انسانی قحطی هلند و ریشه‌های تکاملی سلامت و بیماری در بزرگسالی 5.4 The Dutch Famine human epidemiological studies and the Developmental Origins of Adult Health and Disease

• 5.5 مطالعات اپیدمیولوژیک انسانی بر روی گروه Overkalix، اثرات پدربزرگ و مادربزرگ و احتمال وراثت اپی‌ژنتیکی بین نسلی در انسان 5.5 Human epidemiological studies on the Overkalix cohort, grandparental effects and possibility of transgenerational epigenetic inheritance in humans

• 5.6 درس تکمیلی: مصاحبه با دکتر اندرو کنری 5.6 Extension lecture: Interview with Dr Andrew Keniry

مکانیسم‌های تأثیر محیطی بر کنترل اپی‌ژنتیک و وراثت اپی‌ژنتیکی بین نسلی از طریق گامت‌ها Mechanisms of Environmental Influence on Epigenetic Control and Transgenerational Epigenetic Inheritance Through the Gametes

• 6.1 مطالعات موش و رت در مورد اثرات پدری مواجهه شیمیایی، اثرات رفتار مادری بر ساختار اپی‌ژنتیک 6.1 Mouse and rat studies on paternal effects of chemical exposure, effects of maternal behaviour on epigenetic makeup

• 6.2 وراثت اپی‌ژنتیکی بین نسلی از طریق گامت‌ها 6.2 Transgenerational epigenetic inheritance via the gametes

• 6.3 آلل Agouti viable yellow در موش‌ها 6.3 The Agouti viable yellow allele in mice

• 6.4 اثرات محیطی بر آلل Agouti viable yellow 6.4 Environmental effects on the Agouti viable yellow allele

• 6.5 آلل Axin fused در موش‌ها و اپی-آلل‌های متأصل 6.5 The Axin fused allele in mice and metastable epialleles

• 6.6 مکانیسم‌های احتمالی وراثت اپی‌ژنتیکی بین نسلی: برنامه‌ریزی مجدد اپی‌ژنتیکی ناقص 6.6 Potential mechanisms of transgenerational epigenetic inheritance: incomplete epigenetic reprogramming

• 6.7 پاراموتاسیون در گیاهان و اثرات مشابه پاراموتاسیون در موش‌ها 6.7 Paramutation in plants and paramutation-like effects in mice

• 6.8 اپی-جهش ساختاری در انسان: (عدم وراثت اپی‌ژنتیکی بین نسلی) 6.8 Constitutional epimutation in humans - not transgenerational epigenetic inheritance

اپی‌ژنتیک سرطان Cancer Epigenetics

• 7.1 مرور کلی اپی‌ژنتیک سرطان 7.1 Overview of cancer epigenetics

• 7.2 هایپرمتیلاسیون جزایر CpG در سرطان 7.2 Hypermethylation of CpG islands in cancer

• 7.3 هایپرمتیلاسیون مجموعه‌ای از جزایر CpG در سرطان 7.3 Hypermethylation of sets of CpG islands in cancer

• 7.4 هایپومتیلاسیون در سطح کل ژنوم در سرطان 7.4 Hypomethylation genome-wide in cancer

• 7.5 تغییرات در اصلاحات هیستونی در سرطان 7.5 Altered histone modifications in cancer

• 7.6 تغییرات اپی‌ژنتیکی دوربُرد در سرطان و تغییرات در معماری هسته 7.6 Long range epigenetic alterations in cancer and alterations to nuclear architecture

• 7.7 تغییر بیان piRNAها و RNAهای غیرکدکننده بلند در سرطان 7.7 Altered expression on piRNAs and long noncoding RNAs in cancer

• 7.8 جهش در اصلاح‌کننده‌های اپی‌ژنتیک در سرطان 7.8 Mutations in epigenetic modifiers in cancer

• 7.9 داروهای هدفمند بر ماشین اپی‌ژنتیکی به عنوان شیمی‌درمانی 7.9 Drugs that target the epigenetic machinery as chemotherapeutics

• 7.10 درس تکمیلی: پیری - بخش اول 7.10 Extension lecture: Aging - Part 1

• 7.11 درس تکمیلی: پیری - بخش دوم 7.11 Extension lecture: Aging - Part 2