آیا میخواهید یک بیوانفورماتیک باشید اما نمیدانید چه چیزی به همراه دارد؟ یا شاید شما با مشکلات تجزیه و تحلیل داده های بیولوژیکی دست و پنجه نرم می کنید؟ آیا شما در بین اصطلاحات بیولوژیکی، پزشکی، آماری و تحلیلی اشتباه گرفته اید؟ آیا میخواهید در این زمینه متخصص باشید و بتوانید آزمایشهای بیولوژیکی را طراحی کنید، مفاهیم را به درستی به کار ببرید و تجزیه و تحلیل کاملی از پایان به انتها انجام دهید؟
این یک دوره آموزشی جامع و همه جانبه است که تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل را با تمرکز بر توالی یابی نسل بعدی، RNAseq و PCR کمی (qPCR) به شما آموزش می دهد
در این دوره ما با هم یکی از محبوب ترین زیر تخصص ها در بیوانفورماتیک را می آموزیم: تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل. در پایان این دوره شما قادر خواهید بود هر دو تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل مبتنی بر RNAseq و qPCR را به طور مستقل و توسط خودتان در زبان برنامه نویسی R انجام دهید. بخش RNAseq این دوره جامع ترین است و شامل همه چیزهایی است که برای داشتن مهارت های لازم برای خواندن کتابخانه FASTQ نسل بعدی توالی خوانی و در نهایت تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل کامل نیاز دارید. اگرچه این دوره بر روی R به عنوان یک محیط انتخابی تجزیه و تحلیل بیولوژیکی تمرکز می کند، شما همچنین این فرصت را خواهید داشت که نه تنها در مورد خط لوله TUXEDO مبتنی بر ترمینال یونیکس، بلکه ابزارهای آنلاین نیز بیاموزید. علاوه بر این، شما به خوبی در روش های آماری و مدل سازی مستقر خواهید شد، بنابراین می توانید آنها را توضیح دهید و به طور موثر برای رسیدگی به مشکلات تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل بیوانفورماتیکی استفاده کنید. این دوره به گونه ای ساخته شده است که می توانید ترکیبی از تجزیه و تحلیل عملی و تجربه طراحی تجربی را به دست آورید - جنبه عملی به شما امکان می دهد تجزیه و تحلیل خود را انجام دهید، در حالی که جنبه تئوری به شما کمک می کند با مشکلات غیر منتظره روبرو شوید.
در اینجا خلاصه ای از آنچه آموزش داده می شود و آنچه می توانید با گذراندن این دوره انجام دهید آمده است:
میآموزید و میتوانید آنالیز کامل RNAseq سرتاسری را در خطوط لوله R و TUXEDO انجام دهید: شروع با کتابخانه FASTQ از طریق انجام همترازی، مونتاژ رونویسی، حاشیهنویسی ژنوم، شمارش خواندن و ارزیابی تفاضلی
میآموزید و میتوانید تجزیه و تحلیل qPCR را در R انجام دهید: روش delta-Ct، روش delta-delta-Ct، طراحی تجربی و تفسیر دادهها
شما یاد خواهید گرفت که چگونه دانش زیست شناسی مولکولی را برای حل مشکلات در تجزیه و تحلیل بیان ژن های افتراقی به طور خاص و بیوانفورماتیک به طور کلی حل کنید
شما مبانی فنی qPCR، ریزآرایه، توالی یابی و RNAseq را یاد خواهید گرفت تا بتوانید با اطمینان خاطر با داده های بیان ژن های افتراقی با درک معنای اعداد مقابله کنید
شما دو روش مدلسازی اصلی را در R که برای بیان ژن دیفرانسیل استفاده میشود، یاد خواهید گرفت و میتوانید از آن استفاده کنید: مدل خطی عمومی و همچنین چارچوبهای محصول رتبهبندی غیر پارامتری
درباره روشهای تحلیل مسیر و نحوه استفاده از آنها برای تولید فرضیه خواهید آموخت
میتوانید دادههای بیان ژن را از آزمایشهای خود تجسم کنید و خواهید آموخت
دانشمند داده با سابقه در بیوانفورماتیک
نمایش نظرات