آموزش تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - A تا Z کامل شما

Differential Gene Expression Analysis - Your Complete A to Z

نکته: آخرین آپدیت رو دریافت میکنید حتی اگر این محتوا بروز نباشد.
نمونه ویدیوها:
توضیحات دوره: استاد آنالیز بیوانفورماتیک شوید: qPCR، RNAseq، ژنومیکس عملکردی، ترانسکریپتومیکس، R، RStudio، خط لوله TUXEDO شما قادر خواهید بود دانش زیست شناسی مولکولی را برای حل مشکلات در تجزیه و تحلیل بیان ژن های افتراقی به طور خاص، و بیوانفوماتیک به طور کلی به کار ببرید. قادر به انجام یک خط لوله تجزیه و تحلیل RNAseq انتها به انتها در R شما قادر خواهید بود یک تجزیه و تحلیل qPCR در R انجام دهید شما قادر خواهید بود یک تجزیه و تحلیل مسیر انجام دهید شما قادر خواهید بود آزمایش های بیوانفورماتیکی طراحی کنید و تفسیر داده ها را انجام دهید. پایه محکمی بر روی تکنیک های مورد استفاده در بیوانفورماتیک خواهید داشت مدل های آماری و روش های مورد استفاده در بیان ژن های افتراقی را یاد خواهید گرفت. آشنایی با برنامه نویسی R و خط فرمان ترمینال مانند یونیکس سودمند است، اما ضروری نیست زیرا این موضوع پوشش داده خواهد شد. ذهن باز و آماده برای یادگیری!

آیا می‌خواهید یک بیوانفورماتیک باشید اما نمی‌دانید چه چیزی به همراه دارد؟ یا شاید شما با مشکلات تجزیه و تحلیل داده های بیولوژیکی دست و پنجه نرم می کنید؟ آیا شما در بین اصطلاحات بیولوژیکی، پزشکی، آماری و تحلیلی اشتباه گرفته اید؟ آیا می‌خواهید در این زمینه متخصص باشید و بتوانید آزمایش‌های بیولوژیکی را طراحی کنید، مفاهیم را به درستی به کار ببرید و تجزیه و تحلیل کاملی از پایان به انتها انجام دهید؟

این یک دوره آموزشی جامع و همه جانبه است که تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل را با تمرکز بر توالی یابی نسل بعدی، RNAseq و PCR کمی (qPCR) به شما آموزش می دهد

در این دوره ما با هم یکی از محبوب ترین زیر تخصص ها در بیوانفورماتیک را می آموزیم: تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل. در پایان این دوره شما قادر خواهید بود هر دو تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل مبتنی بر RNAseq و qPCR را به طور مستقل و توسط خودتان در زبان برنامه نویسی R انجام دهید. بخش RNAseq این دوره جامع ترین است و شامل همه چیزهایی است که برای داشتن مهارت های لازم برای خواندن کتابخانه FASTQ نسل بعدی توالی خوانی و در نهایت تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل کامل نیاز دارید. اگرچه این دوره بر روی R به عنوان یک محیط انتخابی تجزیه و تحلیل بیولوژیکی تمرکز می کند، شما همچنین این فرصت را خواهید داشت که نه تنها در مورد خط لوله TUXEDO مبتنی بر ترمینال یونیکس، بلکه ابزارهای آنلاین نیز بیاموزید. علاوه بر این، شما به خوبی در روش های آماری و مدل سازی مستقر خواهید شد، بنابراین می توانید آنها را توضیح دهید و به طور موثر برای رسیدگی به مشکلات تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل بیوانفورماتیکی استفاده کنید. این دوره به گونه ای ساخته شده است که می توانید ترکیبی از تجزیه و تحلیل عملی و تجربه طراحی تجربی را به دست آورید - جنبه عملی به شما امکان می دهد تجزیه و تحلیل خود را انجام دهید، در حالی که جنبه تئوری به شما کمک می کند با مشکلات غیر منتظره روبرو شوید.

در اینجا خلاصه ای از آنچه آموزش داده می شود و آنچه می توانید با گذراندن این دوره انجام دهید آمده است:

  • می‌آموزید و می‌توانید آنالیز کامل RNAseq سرتاسری را در خطوط لوله R و TUXEDO انجام دهید: شروع با کتابخانه FASTQ از طریق انجام هم‌ترازی، مونتاژ رونویسی، حاشیه‌نویسی ژنوم، شمارش خواندن و ارزیابی تفاضلی

  • می‌آموزید و می‌توانید تجزیه و تحلیل qPCR را در R انجام دهید: روش delta-Ct، روش delta-delta-Ct، طراحی تجربی و تفسیر داده‌ها

  • شما یاد خواهید گرفت که چگونه دانش زیست شناسی مولکولی را برای حل مشکلات در تجزیه و تحلیل بیان ژن های افتراقی به طور خاص و بیوانفورماتیک به طور کلی حل کنید

  • شما مبانی فنی qPCR، ریزآرایه، توالی یابی و RNAseq را یاد خواهید گرفت تا بتوانید با اطمینان خاطر با داده های بیان ژن های افتراقی با درک معنای اعداد مقابله کنید

  • شما دو روش مدل‌سازی اصلی را در R که برای بیان ژن دیفرانسیل استفاده می‌شود، یاد خواهید گرفت و می‌توانید از آن استفاده کنید: مدل خطی عمومی و همچنین چارچوب‌های محصول رتبه‌بندی غیر پارامتری

  • درباره روش‌های تحلیل مسیر و نحوه استفاده از آن‌ها برای تولید فرضیه خواهید آموخت

  • می‌توانید داده‌های بیان ژن را از آزمایش‌های خود تجسم کنید و خواهید آموخت


سرفصل ها و درس ها

معرفی دوره Introduction to the course

معرفی دوره Introduction to the course

  • به دوره خوش آمدید! Welcome to the course!

  • به دوره خوش آمدید! Welcome to the course!

  • ساختار دوره، اهداف و اهداف Course structure, aims and objectives

  • ساختار دوره، اهداف و اهداف Course structure, aims and objectives

  • اولین چالش بیوانفورماتیک شما! Your first bioinformatic challenge!

  • اولین چالش بیوانفورماتیک شما! Your first bioinformatic challenge!

  • فایل مسابقه 1 - توضیح Quiz 1 file - an explanation

  • فایل مسابقه 1 - توضیح Quiz 1 file - an explanation

  • این سکانس چیست؟ What is this sequence?

  • این سکانس چیست؟ What is this sequence?

  • آزمون 1 راهنما - انجام جستجوی BLAST Quiz 1 walkthrough - undertaking a BLAST search

  • آزمون 1 راهنما - انجام جستجوی BLAST Quiz 1 walkthrough - undertaking a BLAST search

زیست شناسی برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل Biology for differential gene expression analysis

زیست شناسی برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل Biology for differential gene expression analysis

  • زیست شناسی برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - مقدمه Biology for differential gene expression analysis - introduction

  • زیست شناسی برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - مقدمه Biology for differential gene expression analysis - introduction

  • این چیزی که به آن بیوانفورماتیک می گویند چیست؟ What is this thing called bioinformatics?

  • این چیزی که به آن بیوانفورماتیک می گویند چیست؟ What is this thing called bioinformatics?

  • این چیزی است که به نام بیوانفورماتیک - مسابقه What is this thing called bioinformatics - quiz

  • این چیزی است که به نام بیوانفورماتیک - مسابقه What is this thing called bioinformatics - quiz

  • مروری بر بیان ژن Overview of gene expression

  • مروری بر بیان ژن Overview of gene expression

  • ترجمه کد ژنتیکی - نظریه Translation of genetic code - theory

  • ترجمه کد ژنتیکی - نظریه Translation of genetic code - theory

  • ترجمه کد ژنتیکی - تمرین Translation of genetic code - practice

  • ترجمه کد ژنتیکی - تمرین Translation of genetic code - practice

  • ترجمه چارچوب خواندن (ORF) را باز کنید Open Reading Frame (ORF) translation

  • ترجمه چارچوب خواندن (ORF) را باز کنید Open Reading Frame (ORF) translation

  • راهنما ترجمه Reading Frame را باز کنید Open Reading Frame translation walk-through

  • راهنما ترجمه Reading Frame را باز کنید Open Reading Frame translation walk-through

  • آیا کد ژنتیکی زائد است؟ Is genetic code redundant?

  • آیا کد ژنتیکی زائد است؟ Is genetic code redundant?

  • ساختار ژن و پیوند Gene structure and splicing

  • ساختار ژن و پیوند Gene structure and splicing

  • تغییرات mRNA mRNA modifications

  • تغییرات mRNA mRNA modifications

  • زیست شناسی برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - خلاصه بخش Biology for differential gene expression analysis - section summary

  • زیست شناسی برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - خلاصه بخش Biology for differential gene expression analysis - section summary

توالی یابی، PCR و ریزآرایه ها - پایه فنی Sequencing, PCR and microarrays - technical foundation

توالی یابی، PCR و ریزآرایه ها - پایه فنی Sequencing, PCR and microarrays - technical foundation

  • تکنیک های آزمایشگاهی برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - مقدمه Lab techniques for differential gene expression analysis - intro

  • تکنیک های آزمایشگاهی برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - مقدمه Lab techniques for differential gene expression analysis - intro

  • ترتیب دهی Sequencing

  • ترتیب دهی Sequencing

  • PCR PCR

  • PCR PCR

  • توالی سانگر Sanger sequencing

  • توالی سانگر Sanger sequencing

  • توالی یابی نسل بعدی Next generation sequencing

  • توالی یابی نسل بعدی Next generation sequencing

  • تکنیک های آزمایشگاهی برای بیان ژن افتراقی Lab techniques for differential gene expression

  • تکنیک های آزمایشگاهی برای بیان ژن افتراقی Lab techniques for differential gene expression

  • ریزآرایه ها Microarrays

  • ریزآرایه ها Microarrays

  • تکنیک های آزمایشگاهی برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - خلاصه بخش Lab techniques for differential gene expression analysis - section summary

  • تکنیک های آزمایشگاهی برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - خلاصه بخش Lab techniques for differential gene expression analysis - section summary

پایه تجربی، آماری و تحلیلی به همراه PCR کمی Experimental, statistical and analytical foundation plus quantitative PCR

پایه تجربی، آماری و تحلیلی به همراه PCR کمی Experimental, statistical and analytical foundation plus quantitative PCR

  • اولین چیزها - نصب RStudio First things first - RStudio installation

  • اولین چیزها - نصب RStudio First things first - RStudio installation

  • بیان ژن دیفرانسیل - مبانی Differential gene expression - fundamentals

  • بیان ژن دیفرانسیل - مبانی Differential gene expression - fundamentals

  • آماده سازی نمونه برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل Sample preparation for differential gene expression analysis

  • آماده سازی نمونه برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل Sample preparation for differential gene expression analysis

  • اندازه گیری بیان ژن با qPCR Measuring gene expression with qPCR

  • اندازه گیری بیان ژن با qPCR Measuring gene expression with qPCR

  • کمیت qPCR بیان ژن qPCR quantification of gene expression

  • کمیت qPCR بیان ژن qPCR quantification of gene expression

  • مسابقه qPCR - قسمت 1 - مقدمه qPCR quiz - part 1 - intro

  • مسابقه qPCR - قسمت 1 - مقدمه qPCR quiz - part 1 - intro

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 1 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 1

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 1 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 1

  • راهنمای آزمون qPCR - قسمت 1 qPCR quiz walkthrough - part 1

  • راهنمای آزمون qPCR - قسمت 1 qPCR quiz walkthrough - part 1

  • ملاحظات تجربی برای بیان ژن افتراقی Experimental considerations for differential gene expression

  • ملاحظات تجربی برای بیان ژن افتراقی Experimental considerations for differential gene expression

  • ملاحظات آماری برای بیان ژن افتراقی Statistical considerations for differential gene expression

  • ملاحظات آماری برای بیان ژن افتراقی Statistical considerations for differential gene expression

  • تجزیه و تحلیل qPCR صفحه گسترده: حفظ تنوع بیان Spreadsheet qPCR analysis: preserving variability of expression

  • تجزیه و تحلیل qPCR صفحه گسترده: حفظ تنوع بیان Spreadsheet qPCR analysis: preserving variability of expression

  • تجزیه و تحلیل داده ها در RStudio Data analysis in RStudio

  • تجزیه و تحلیل داده ها در RStudio Data analysis in RStudio

  • آماده شدن برای مسابقه بعدی شما: منسوخ شدن بسته داده و توابع Getting ready for your next quiz: dat package deprecation and functions

  • آماده شدن برای مسابقه بعدی شما: منسوخ شدن بسته داده و توابع Getting ready for your next quiz: dat package deprecation and functions

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q1 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q1

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q1 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q1

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q1 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q1

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q1 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q1

  • قسمت 2 - Q1 Walkthrough Part 2 - Q1 Walkthrough

  • قسمت 2 - Q1 Walkthrough Part 2 - Q1 Walkthrough

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q2 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q2

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q2 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q2

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q2 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q2

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q2 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q2

  • قسمت 2 - بررسی Q2 Part 2 - Q2 walkthrough

  • قسمت 2 - بررسی Q2 Part 2 - Q2 walkthrough

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q3 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q3

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q3 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q3

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q3 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q3

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q3 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q3

  • قسمت 2 - بررسی Q3 Part 2 - Q3 walkthrough

  • قسمت 2 - بررسی Q3 Part 2 - Q3 walkthrough

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q4 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q4

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q4 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q4

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q3 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q3

  • آیا بیان این سرکوبگر تومور تحت تأثیر این دارو است؟ - قسمت 2 - Q3 Is the expression of this tumour suppressor affected by this drug? - Part 2 - Q3

  • قسمت 2 - بررسی Q4 Part 2 - Q4 walkthrough

  • قسمت 2 - بررسی Q4 Part 2 - Q4 walkthrough

غواصی عمیق در RNAseq و روش های تجزیه و تحلیل A deep dive into RNAseq and analysis methods

غواصی عمیق در RNAseq و روش های تجزیه و تحلیل A deep dive into RNAseq and analysis methods

  • مقدمه ای بر RNAseq Intro to RNAseq

  • مقدمه ای بر RNAseq Intro to RNAseq

  • مزایای تحلیلی RNAseq و مروری بر خط لوله تجزیه و تحلیل RNAseq Analytical advantages of RNAseq and overview of RNAseq analysis pipeline

  • مزایای تحلیلی RNAseq و مروری بر خط لوله تجزیه و تحلیل RNAseq Analytical advantages of RNAseq and overview of RNAseq analysis pipeline

  • آزمون های سریع RNAseq RNAseq quick quizzes

  • آزمون های سریع RNAseq RNAseq quick quizzes

  • خط لوله تجزیه و تحلیل RNAseq RNAseq analysis pipeline

  • خط لوله تجزیه و تحلیل RNAseq RNAseq analysis pipeline

  • FastQC: ارزیابی کیفیت کتابخانه توالی یابی FastQC: assessing the quality of sequencing library

  • FastQC: ارزیابی کیفیت کتابخانه توالی یابی FastQC: assessing the quality of sequencing library

  • تمرین FastQC شما Your FastQC exercise

  • تمرین FastQC شما Your FastQC exercise

  • آیا باید این کتابخانه مطالب را کوتاه کنم؟ Should I trim this library of reads?

  • آیا باید این کتابخانه مطالب را کوتاه کنم؟ Should I trim this library of reads?

  • مرحله تمرین FastQC FastQC exercise walkthrough

  • مرحله تمرین FastQC FastQC exercise walkthrough

  • تراز (TUXEDO) Alignment (TUXEDO)

  • تراز (TUXEDO) Alignment (TUXEDO)

  • تراز (Rsubread) Alignment (Rsubread)

  • تراز (Rsubread) Alignment (Rsubread)

  • مسابقه هم ترازی Rsubread Rsubread alignment quiz

  • مسابقه هم ترازی Rsubread Rsubread alignment quiz

  • هم ترازی Rsubread: معیارهای تراز سختگیرانه در برابر کمتر Rsubread alignment: stringent vs. less stringent alignment criteria

  • هم ترازی Rsubread: معیارهای تراز سختگیرانه در برابر کمتر Rsubread alignment: stringent vs. less stringent alignment criteria

  • مسابقه هم ترازی سخت و کمتر سخت گیرانه Strict and less strict alignment quiz

  • مسابقه هم ترازی سخت و کمتر سخت گیرانه Strict and less strict alignment quiz

  • بررسی تراز دقیق و کمتر دقیق Strict and less strict alignment walkthrough

  • بررسی تراز دقیق و کمتر دقیق Strict and less strict alignment walkthrough

  • بررسی دقیق و کمتر سخت گیرانه آزمون تراز Strict and less strict alignment quiz walkthrough

  • بررسی دقیق و کمتر سخت گیرانه آزمون تراز Strict and less strict alignment quiz walkthrough

  • مونتاژ رونوشت (TUXEDO) Transcriptome assembly (TUXEDO)

  • مونتاژ رونوشت (TUXEDO) Transcriptome assembly (TUXEDO)

  • نصب برنامه های کاف از جعبه ابزار TUXEDO Installing Cuff-apps from TUXEDO toolkit

  • نصب برنامه های کاف از جعبه ابزار TUXEDO Installing Cuff-apps from TUXEDO toolkit

  • مقایسه حاشیه نویسی ژنوم با Cuffcompare Comparing genome annotations with Cuffcompare

  • مقایسه حاشیه نویسی ژنوم با Cuffcompare Comparing genome annotations with Cuffcompare

  • مسابقه حاشیه نویسی ژنوم مقایسه کنید Cuffcompare genome annotation quiz

  • مسابقه حاشیه نویسی ژنوم مقایسه کنید Cuffcompare genome annotation quiz

  • مقدمه آزمون مقایسه کاف Cuffcompare quiz walkthrough

  • مقدمه آزمون مقایسه کاف Cuffcompare quiz walkthrough

  • تعداد خواندن و FPKM/RPKM Read counts and FPKM/RPKM

  • تعداد خواندن و FPKM/RPKM Read counts and FPKM/RPKM

  • مسابقه FPKM FPKM quiz

  • مسابقه FPKM FPKM quiz

  • شمارش خواندن (TUXEDO) Read counting (TUXEDO)

  • شمارش خواندن (TUXEDO) Read counting (TUXEDO)

  • تعداد خوانده شده (Rsubread) Read counts (Rsubread)

  • تعداد خوانده شده (Rsubread) Read counts (Rsubread)

  • عادی سازی RPKM (R) RPKM normalization (R)

  • عادی سازی RPKM (R) RPKM normalization (R)

  • تعداد خوانده شده را به RPKM تبدیل کنید Convert read counts to RPKMs

  • تعداد خوانده شده را به RPKM تبدیل کنید Convert read counts to RPKMs

  • تبدیل تعداد خواندن به RPKM - مسابقه Convert read counts to RPKMs - quiz

  • تبدیل تعداد خواندن به RPKM - مسابقه Convert read counts to RPKMs - quiz

  • مسابقه 18 - کد برای دریافت پاسخ های اولیه Quiz 18 - Code to get the answers walkthrough

  • مسابقه 18 - کد برای دریافت پاسخ های اولیه Quiz 18 - Code to get the answers walkthrough

  • بیان ژن افتراقی (TUXEDO) Differential gene expression (TUXEDO)

  • بیان ژن افتراقی (TUXEDO) Differential gene expression (TUXEDO)

  • مدل های خطی عمومی (GLMs) برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - بخش 1 General Linear Models (GLMs) for differential gene expression analysis - part 1

  • مدل های خطی عمومی (GLMs) برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - بخش 1 General Linear Models (GLMs) for differential gene expression analysis - part 1

  • GLM ها برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - بخش 2 GLMs for differential gene expression analysis - part 2

  • GLM ها برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - بخش 2 GLMs for differential gene expression analysis - part 2

  • GLMs برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - بخش 3 GLMs for differential gene expression analysis - part 3

  • GLMs برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - بخش 3 GLMs for differential gene expression analysis - part 3

  • GLMs برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - قسمت 4 GLMs for differential gene expression analysis - part 4

  • GLMs برای تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - قسمت 4 GLMs for differential gene expression analysis - part 4

  • آزمون GLMs GLMs quiz

  • آزمون GLMs GLMs quiz

  • طراحی ماتریس برای GLM ها Design matrices for GLMs

  • طراحی ماتریس برای GLM ها Design matrices for GLMs

  • پردازش تعداد خواندن بیشتر برای تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل Further read count processing for differential expression analysis

  • پردازش تعداد خواندن بیشتر برای تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل Further read count processing for differential expression analysis

  • بیان دیفرانسیل (R's GLM): limma، edgeR Differential expression (R's GLM): limma, edgeR

  • بیان دیفرانسیل (R's GLM): limma، edgeR Differential expression (R's GLM): limma, edgeR

  • بیان دیفرانسیل: تأثیر فیلتر کردن و عادی سازی Differential expression: impact of filtering & normalization

  • بیان دیفرانسیل: تأثیر فیلتر کردن و عادی سازی Differential expression: impact of filtering & normalization

  • مسابقه بیان دیفرانسیل Differential expression quiz

  • مسابقه بیان دیفرانسیل Differential expression quiz

  • آزمون بیان دیفرانسیل Differential expression quiz walkthrough

  • آزمون بیان دیفرانسیل Differential expression quiz walkthrough

  • بیان دیفرانسیل: RankProd Differential expression: RankProd

  • بیان دیفرانسیل: RankProd Differential expression: RankProd

  • بیان دیفرانسیل با RankProd در R Differential expression with RankProd in R

  • بیان دیفرانسیل با RankProd در R Differential expression with RankProd in R

  • مسابقه RankProd RankProd Quiz

  • مسابقه RankProd RankProd Quiz

  • بررسی RankProd Quiz RankProd Quiz walkthrough

  • بررسی RankProd Quiz RankProd Quiz walkthrough

تحلیل مسیر برای تولید فرضیه Pathway analysis for hypothesis generation

تحلیل مسیر برای تولید فرضیه Pathway analysis for hypothesis generation

  • تحلیل مسیر - رویکردهای ORA + GSEA Pathway analysis - ORA + GSEA approaches

  • تحلیل مسیر - رویکردهای ORA + GSEA Pathway analysis - ORA + GSEA approaches

  • دست در تجزیه و تحلیل مسیر مبتنی بر ORA Hands on ORA-based pathway analysis

  • دست در تجزیه و تحلیل مسیر مبتنی بر ORA Hands on ORA-based pathway analysis

  • آزمون ORA ORA Quiz

  • آزمون ORA ORA Quiz

  • دست در تجزیه و تحلیل مسیر مبتنی بر GSEA Hands on GSEA-based pathway analysis

  • دست در تجزیه و تحلیل مسیر مبتنی بر GSEA Hands on GSEA-based pathway analysis

  • آزمون GSEA GSEA Quiz

  • آزمون GSEA GSEA Quiz

  • استفاده از تحلیل مسیر در مطالعات بدون فرضیه Using pathway analysis in hypothesis-free studies

  • استفاده از تحلیل مسیر در مطالعات بدون فرضیه Using pathway analysis in hypothesis-free studies

تجسم بیان ژن Gene expression visualization

تجسم بیان ژن Gene expression visualization

  • تجسم داده های بیان ژن Visualization of gene expression data

  • تجسم داده های بیان ژن Visualization of gene expression data

  • تجزیه و تحلیل نمودار ون Venn diagram analysis

  • تجزیه و تحلیل نمودار ون Venn diagram analysis

  • استفاده از Venny برای تجزیه و تحلیل نمودار ون - مسابقه Using Venny for venn diagram analysis - quiz

  • استفاده از Venny برای تجزیه و تحلیل نمودار ون - مسابقه Using Venny for venn diagram analysis - quiz

  • یاد بگیرید که داده های بیان ژن را در R تجسم کنید Learn to visualize gene expression data in R

  • یاد بگیرید که داده های بیان ژن را در R تجسم کنید Learn to visualize gene expression data in R

  • تجسم داده های بیان ژن در تمرین Visualization of gene expression data hands on exercise

  • تجسم داده های بیان ژن در تمرین Visualization of gene expression data hands on exercise

پروژه اصلی شما Your capstone project

پروژه اصلی شما Your capstone project

  • پروژه Capstone Capstone project

  • پروژه Capstone Capstone project

  • مواد پروژه Capstone Capstone project materials

  • مواد پروژه Capstone Capstone project materials

  • بررسی پروژه Capstone Capstone project walkthrough

  • بررسی پروژه Capstone Capstone project walkthrough

نمایش نظرات

آموزش تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل - A تا Z کامل شما
جزییات دوره
8.5 hours
85
Udemy (یودمی) Udemy (یودمی)
(آخرین آپدیت)
2,263
4.4 از 5
دارد
دارد
دارد
جهت دریافت آخرین اخبار و آپدیت ها در کانال تلگرام عضو شوید.

Google Chrome Browser

Internet Download Manager

Pot Player

Winrar

Alexander Abdulkader Kheirallah, PhD Alexander Abdulkader Kheirallah, PhD

دانشمند داده با سابقه در بیوانفورماتیک