آموزش پایتون برای زیست‌شناسان و مبتدیان - آخرین آپدیت

سرفصل ها و درس ها

Introduction-مقدمه Introduction

• Introduction-مقدمه Introduction

Basic Biology Review-مروری بر زیست شناسی پایه Basic Biology Review

• DNA-DNA DNA

• RNA-RNA RNA

• Proteins-پروتئین‌ها Proteins

• File Formats-فرمت‌های فایل File Formats

• Practice Quiz-آزمون تمرینی Practice Quiz

Python Introduction-معرفی پایتون Python Introduction

• Introduction to Python-معرفی پایتون Introduction to Python

• Anaconda Installation-نصب Anaconda Anaconda Installation

Variables, Numerics and Strings-متغیرها، اعداد و رشته‌ها Variables, Numerics and Strings

• Concept of Variables-مفهوم متغیرها Concept of Variables

• Numerics and Mathematical Operations-اعداد و عملیات ریاضی Numerics and Mathematical Operations

• String initialization and Typecasting-مقداردهی اولیه رشته‌ها و تبدیل نوع String initialization and Typecasting

• String Analysis Part I-تحلیل رشته‌ها بخش اول String Analysis Part I

• String Analysis Part II-تحلیل رشته‌ها بخش دوم String Analysis Part II

• String Analysis Part III-تحلیل رشته‌ها بخش سوم String Analysis Part III

• String Analysis Part IV-تحلیل رشته‌ها بخش چهارم String Analysis Part IV

• String Analysis Part V-تحلیل رشته‌ها بخش پنجم String Analysis Part V

• String Analysis Part VI-تحلیل رشته‌ها بخش ششم String Analysis Part VI

• String Analysis Activities-فعالیت‌های تحلیل رشته String Analysis Activities

• Practice Quiz-آزمون تمرینی Practice Quiz

• Assignment 1-تکلیف 1 Assignment 1

Handling Files with Ease-کار با فایل‌ها به آسانی Handling Files with Ease

• Introduction-مقدمه Introduction

• Read Files: Approach 1-خواندن فایل‌ها: رویکرد 1 Read Files: Approach 1

• Read Files: Approach 2-خواندن فایل‌ها: رویکرد 2 Read Files: Approach 2

• Copy File path on Windows (Optional)-کپی مسیر فایل در ویندوز (اختیاری) Copy File path on Windows (Optional)

• Read Files on Google Colab (Optional)-خواندن فایل‌ها در Google Colab (اختیاری) Read Files on Google Colab (Optional)

• Write Files-نوشتن فایل‌ها Write Files

• Append Files-افزودن به فایل‌ها Append Files

• Practice Quiz-آزمون تمرینی Practice Quiz

Mastering Lists and Tuples-تسلط بر لیست‌ها و تاپل‌ها Mastering Lists and Tuples

• Initializing Lists and Tuples-مقداردهی اولیه لیست‌ها و تاپل‌ها Initializing Lists and Tuples

• List and Tuple Interconversion-تبدیل بین لیست و تاپل List and Tuple Interconversion

• List and Tuple Length (len())-طول لیست و تاپل (len()) List and Tuple Length (len())

• List and String Interconversion-تبدیل بین لیست و رشته List and String Interconversion

• List and Tuple Slicing-برش لیست و تاپل List and Tuple Slicing

• Counting elements of List and Tuple-شمارش عناصر لیست و تاپل Counting elements of List and Tuple

• List and String Concatenation-الحاق لیست و رشته List and String Concatenation

• List and List Concatenation-الحاق لیست و لیست List and List Concatenation

• Append Vs Extend-Append در مقابل Extend Append Vs Extend

• Cloning Lists-کپی کردن (Clone) لیست‌ها Cloning Lists

• Cloning Tuples-کپی کردن (Clone) تاپل‌ها Cloning Tuples

• Deleting Lists and Tuples-حذف لیست‌ها و تاپل‌ها Deleting Lists and Tuples

• Sorting List and Tuples-مرتب‌سازی لیست و تاپل Sorting List and Tuples

• Membership Operator-عملگر عضویت Membership Operator

• Mathematical Operations-عملیات ریاضی Mathematical Operations

• Logical Check: any() Vs all()-بررسی منطقی: any() در مقابل all() Logical Check: any() Vs all()

• Data pairing with zip()-جفت کردن داده‌ها با zip() Data pairing with zip()

• Activity 1-فعالیت 1 Activity 1

Loops: Automating Repetition-حلقه‌ها: اتوماتیک کردن تکرار Loops: Automating Repetition

• List Comprehension: One liner 'for' loop-فهرست‌نویسی: حلقه for یک خطی List Comprehension: One liner 'for' loop

• For Loops-حلقه‌های For For Loops

• Nested Loops-حلقه‌های تو در تو Nested Loops

• While Loops-حلقه‌های While While Loops

• Practice Quiz-آزمون تمرینی Practice Quiz

Conditional Statement: If, Else, Elif-عبارت شرطی: If, Else, Elif Conditional Statement: If, Else, Elif

• Logical Operators-عملگرهای منطقی Logical Operators

• Decision Making-تصمیم‌گیری Decision Making

• Practice Quiz-آزمون تمرینی Practice Quiz

Biopython: Toolkit for Bioinformatics-Biopython: ابزار برای بیوانفورماتیک Biopython: Toolkit for Bioinformatics

• String to Seq-رشته به Seq String to Seq

• Analyzing Fasta-تحلیل Fasta Analyzing Fasta

• Customizing Output-سفارشی‌سازی خروجی Customizing Output

• Practice Quiz-آزمون تمرینی Practice Quiz

Dictionaries: Efficient Data Storage-دیکشنری‌ها: ذخیره‌سازی کارآمد داده‌ها Dictionaries: Efficient Data Storage

• Introduction to Dictionary-مقدمه‌ای بر دیکشنری Introduction to Dictionary

• Initializing Dictionary-مقداردهی اولیه دیکشنری Initializing Dictionary

• Dictionary Analysis: Part I-تحلیل دیکشنری: بخش اول Dictionary Analysis: Part I

• Dictionary Analysis: Part II-تحلیل دیکشنری: بخش دوم Dictionary Analysis: Part II

• Dictionary Analysis: Part III-تحلیل دیکشنری: بخش سوم Dictionary Analysis: Part III

• Dictionary Analysis: Part IV-تحلیل دیکشنری: بخش چهارم Dictionary Analysis: Part IV

• Dictionary Analysis: Part V-تحلیل دیکشنری: بخش پنجم Dictionary Analysis: Part V

• Practice Quiz-آزمون تمرینی Practice Quiz

Function: The Building Blocks-تابع: بلوک‌های سازنده Function: The Building Blocks

• Functions: Definition and Call-توابع: تعریف و فراخوانی Functions: Definition and Call

• Function Attributes-ویژگی‌های تابع Function Attributes

• Positional Vs Keyword Arguments-آرگومان‌های موقعیتی در مقابل کلیدواژه‌ای Positional Vs Keyword Arguments

• Dynamic Arguments-آرگومان‌های پویا Dynamic Arguments

• Assignment 2-تکلیف 2 Assignment 2

Regular Expression Made Easy-عبارت باقاعده آسان شد Regular Expression Made Easy

• Introduction to regular expression-مقدمه‌ای بر عبارت باقاعده Introduction to regular expression

• Pattern Search-جستجوی الگو Pattern Search

• Pattern search at beginning and end-جستجوی الگو در ابتدا و انتها Pattern search at beginning and end

• Quantifiers Part I-کمی‌سازها بخش اول Quantifiers Part I

• Quantifiers Part II-کمی‌سازها بخش دوم Quantifiers Part II

• Quantifiers Part III-کمی‌سازها بخش سوم Quantifiers Part III

• Quantifiers Part IV-کمی‌سازها بخش چهارم Quantifiers Part IV

• Multiple Pattern Search-جستجوی الگوی چندگانه Multiple Pattern Search

• Split using regular expression-تقسیم با استفاده از عبارت باقاعده Split using regular expression

• Replace using regular expression-جایگزینی با استفاده از عبارت باقاعده Replace using regular expression

• Wildcard Character-کاراکتر Wildcard Wildcard Character

• Grouping in regular expression-گروه‌بندی در عبارت باقاعده Grouping in regular expression

• Assignment 3-تکلیف 3 Assignment 3

Working with DataFrames-کار با DataFrames Working with DataFrames

• Introduction to DataFrame-مقدمه‌ای بر DataFrame Introduction to DataFrame

• DataFrame: .head() and .tail()-DataFrame: .head() و .tail() DataFrame: .head() and .tail()

• DataFrame: row/column names and summary-DataFrame: نام‌های سطر/ستون و خلاصه DataFrame: row/column names and summary

• DataFrame: shape and dimension-DataFrame: شکل و بعد DataFrame: shape and dimension

• Columns to row names-ستون‌ها به نام‌های سطر Columns to row names

• Column Slicing Part I-برش ستون بخش اول Column Slicing Part I

• Column Slicing Part II-برش ستون بخش دوم Column Slicing Part II

• Row Slicing-برش سطر Row Slicing

• Simultaneous slicing of row(s) and column(s)-برش همزمان سطر(ها) و ستون(ها) Simultaneous slicing of row(s) and column(s)

• Slicing Summary-خلاصه برش Slicing Summary

• Conditional filtering in DataFrame-فیلتر شرطی در DataFrame Conditional filtering in DataFrame

• Conditional mutation in DataFrame-جهش شرطی در DataFrame Conditional mutation in DataFrame

• Adding new column/row-افزودن ستون/سطر جدید Adding new column/row

• Deleting row(s)/column(s)-حذف سطر(ها)/ستون(ها) Deleting row(s)/column(s)

• Missing Values: isna()-مقادیر گمشده: isna() Missing Values: isna()

• Missing Values: dropna()-مقادیر گمشده: dropna() Missing Values: dropna()

• Missing Values: fillna()-مقادیر گمشده: fillna() Missing Values: fillna()

• Combine DataFrames-ترکیب DataFrames Combine DataFrames

• Axis selection-انتخاب محور Axis selection

• Practice Quiz-آزمون تمرینی Practice Quiz

Data Visualization-تصویرسازی داده‌ها Data Visualization

• Introduction to matplotlib and seaborn-مقدمه‌ای بر matplotlib و seaborn Introduction to matplotlib and seaborn

• Scatter Plot-نمودار پراکندگی Scatter Plot

• Line Plot-نمودار خطی Line Plot

• Multiple Line Plot-نمودار خطی چندگانه Multiple Line Plot

• Bar Plot-نمودار میله‌ای Bar Plot

• Histogram-هیستوگرام Histogram

• Pie Plot-نمودار دایره‌ای Pie Plot

• Box Plot-نمودار جعبه‌ای Box Plot

• Heatmaps-نقشه‌های حرارتی Heatmaps

• Practice Quiz-آزمون تمرینی Practice Quiz