آموزش آشنایی با زیست‌شناسی سیستم‌ها (Systems Biology) - آخرین آپدیت

دانلود Introduction to Systems Biology

نکته: ممکن هست محتوای این صفحه بروز نباشد ولی دانلود دوره آخرین آپدیت می باشد.
نمونه ویدیوها:
توضیحات دوره: این دوره دانشجویان را با زیست‌شناسی سیستم‌های مدرن با تمرکز بر سلول‌های پستانداران، اجزای تشکیل‌دهنده و عملکردهای آن‌ها آشنا می‌کند. زیست‌شناسی در حال گذار از دیدگاه مولکولی به دیدگاه ماژولار است. با تعمیق دانش ما در مورد ژنوم و بیان ژن و توسعه لیست‌هایی از مولکول‌ها (پروتئین‌ها، لیپیدها، یون‌ها) که در فرآیندهای سلولی نقش دارند، نیاز داریم درک کنیم که این مولکول‌ها چگونه با یکدیگر تعامل می‌کنند تا ماژول‌هایی را تشکیل دهند که به عنوان سیستم‌های عملکردی مجزا عمل می‌کنند. این سیستم‌ها زیربنای فرآیندهای اصلی زیرسلولی مانند انتقال سیگنال، رونویسی، تحرک و تحریک‌پذیری الکتریکی هستند. به نوبه خود، این فرآیندها در کنار هم قرار می‌گیرند تا رفتارهای سلولی مانند ترشح، تکثیر و پتانسیل‌های عمل را به نمایش بگذارند. ویژگی‌های این سیستم‌های زیرسلولی و سلولی چیست؟ مکانیسم‌هایی که باعث ایجاد رفتارهای نوظهور در سیستم‌ها می‌شوند کدامند؟ چه نوع آزمایش‌هایی تفکر در سطح سیستم را تقویت می‌کنند؟ چرا برای درک این سیستم‌ها به محاسبات و شبیه‌سازی‌ها نیاز داریم؟ این دوره خطوط استدلالی متعددی را برای پاسخ به سوالات فوق توسعه می‌دهد. دو محور اصلی استدلالی عبارتند از: طراحی، اجرا و تفسیر آزمایش‌های چندمتغیره که مجموعه‌داده‌های بزرگی تولید می‌کنند؛ و استدلال‌های کمی، مدل‌ها و شبیه‌سازی‌ها. در این دوره مثال‌هایی برای نمایش «چگونگی» ایجاد عملکردهای سطح سلولی و «چرا» دانش مکانیکی به ما اجازه می‌دهد رفتارهای سلولی منجر به بیماری‌ها و پاسخ‌های دارویی را پیش‌بینی کنیم، مورد بحث قرار خواهد گرفت.

سرفصل ها و درس ها

استدلال در سطح سیستم | از مولکول‌ها تا مسیرها Systems Level Reasoning | Molecules to Pathways

  • مروری بر استدلال سطح سیستم و مسیر مولکولی Overview of Systems Level Reasoning & Molecules to Pathways

  • استدلال سطح سیستم - بخش اول Systems Level Reasoning I

  • استدلال سطح سیستم - بخش دوم Systems Level Reasoning II

  • از مولکول‌ها تا مسیرها | مسیرهای cAMP و پروتئین G - بخش اول Molecules to Pathways - cAMP and G Protein Pathways I

  • از مولکول‌ها تا مسیرها | مسیرهای cAMP و پروتئین G - بخش دوم Molecules to Pathways - cAMP and G Protein Pathways II

از مسیرها تا شبکه‌ها | نیروهای فیزیکی و فعالیت الکتریکی در زیست‌شناسی سلولی Pathways to Networks | Physical Forces and Electrical Activity in Cell Biology

  • از مسیرها تا شبکه‌ها | مسیر/شبکه MAP kinase - بخش اول Pathways to Networks - MAP-kinase Pathways/Network I

  • از مسیرها تا شبکه‌ها | مسیر/شبکه MAP kinase - بخش دوم Pathways to Networks - MAP-kinase Pathways/Network II

  • نیروهای مکانیکی در زیست‌شناسی سلولی Mechanical Forces in Cell Biology

  • فعالیت الکتریکی در زیست‌شناسی سلولی Electrical Activity in Cell Biology

نمایش‌های ریاضی سیستم‌های زیست‌شناسی سلولی | شبیه‌سازی سیستم‌های زیست‌شناسی سلولی Mathematical Representations of Cell Biological Systems | Simulations of Cell Biological Systems

  • نمایش‌های ریاضی سیستم‌های زیست‌شناسی سلولی - بخش اول Mathematical Representations of Cell Biological Systems I

  • نمایش‌های ریاضی سیستم‌های زیست‌شناسی سلولی - بخش دوم Mathematical Representations of Cell Biological Systems II

  • شبیه‌سازی سیستم‌های زیست‌شناسی سلولی - بخش اول Simulations of Cell Biological Systems I

  • شبیه‌سازی سیستم‌های زیست‌شناسی سلولی - بخش دوم Simulations of Cell Biological Systems II

تکنولوژی‌های آزمایشگاهی | ساخت و تحلیل شبکه Experimental Technologies | Network Building and Analysis

  • تکنولوژی‌های آزمایشگاهی Experimental Technologies

  • تحلیل مجموعه‌داده‌های بزرگ Analyzing Large Data Sets

  • ساخت/تحلیل شبکه و سازماندهی داده‌ها Network Building/Analysis and Data Organization

  • ساخت شبکه‌ها Building Networks

امتحان میان‌ترم Midterm

تحلیل شبکه‌ها | از توپولوژی تا عملکرد Analysis of Networks | Topology to Function

  • تحلیل شبکه‌ها - بخش اول Analysis of Networks I

  • تحلیل شبکه‌ها - بخش دوم Analysis of Networks II

  • از توپولوژی تا عملکرد: گراف‌های جهت‌دار با علامت مشخص - بخش اول From Topology to Function: Directed Sign Specified Graphs I

  • از توپولوژی تا عملکرد: گراف‌های جهت‌دار با علامت مشخص - بخش دوم From Topology to Function: Directed Sign Specified Graphs II

نقاط قوت و محدودیت‌های انواع مدل‌ها | شناسایی ویژگی‌های نوظهور Strengths and Limitations of Different Types of Models | Identifying Emergent Properties

  • نقاط قوت و محدودیت انواع مدل‌ها - بخش اول Strengths and Limitations of Different Types of Models I

  • نقاط قوت و محدودیت انواع مدل‌ها - بخش دوم Strengths and Limitations of Different Types of Models II

  • شناسایی ویژگی‌های نوظهور: دوشکلی (Bistability) - بخش اول Identifying Emergent Properties: Bistability I

  • شناسایی ویژگی‌های نوظهور: دوشکلی (Bistability) - بخش دوم Identifying Emergent Properties: Bistability II

ویژگی‌های نوظهور: حساسیت فوق‌العاده و استحکام | مطالعات موردی Emergent Properties: Ultrasensitivity and Robustness | Case Studies

  • حساسیت فوق‌العاده (Ultrasensitivity) Ultrasensitivity

  • استحکام و داربست‌ها Robustness and Scaffolds

  • مطالعات موردی - بخش اول Case Studies I

  • مطالعات موردی - بخش دوم Case Studies II

مطالعات موردی | زیست‌پزشکی سیستم‌ها | فارماکولوژی و درمان‌های سیستمیک | چشم‌انداز Case Studies | Systems Biomedicine | Systems Pharmacology and Therapeutics | Perspective

  • مطالعات موردی - بخش سوم Case Studies III

  • مطالعات موردی - بخش چهارم Case Studies IV

  • زیست‌پزشکی سیستم‌ها Systems Biomedicine

  • فارماکولوژی و درمان‌های سیستمیک Systems Pharmacology and Therapeutics

  • چشم‌انداز نهایی Perspective

امتحان نهایی Final

نمایش نظرات