آموزش مقدمه‌ای بر داده‌های بالینی - آخرین آپدیت

پرس‌وجو و پاسخ به سوالات از طریق داده‌کاوی بالینی Asking and answering questions via clinical data mining

• خوش‌آمدگویی Welcome

• مقدمه‌ای بر گردش‌کار داده‌کاوی Introduction to the data mining workflow

• مثال‌های واقعی Real Life Example

• مثال: یافتن بیماران مشابه Example: Finding similar patients

• مثال: تخمین ریسک Example: Estimating risk

• قرار دادن داده‌های بیمار در خط زمانی Putting patient data on timeline

• مرور مجدد مراحل گردش‌کار داده‌کاوی Revisit the data mining workflow steps

• انواع سوالات پژوهشی Types of research questions

• سوالات پژوهشی مناسب برای داده‌های بالینی Research questions suited for clinical data

• مثال: تصمیم‌گیری برای درمان Example: making decision to treat

• ویژگی‌هایی که پاسخ به یک سوال پژوهشی را مفید می‌سازد Properties that make answering a research question useful

• جمع‌بندی Wrap Up

داده‌های موجود در سیستم‌های بهداشتی و درمانی Data available from Healthcare systems

• مرور سیستم بهداشت و درمان Review of the healthcare system

• مرور موجودیت‌های کلیدی و داده‌هایی که جمع‌آوری می‌کنند Review of key entities and the data they collect

• بازیگران با منافع مختلف Actors with different interests

• انواع رایج داده‌ها در حوزه بهداشت و درمان Common data types in Healthcare

• نقاط قوت و ضعف داده‌های مشاهده‌ای Strengths and weaknesses of observational data

• سوگیری و خطا از دیدگاه سیستم بهداشتی Bias and error from the healthcare system perspective

• سوگیری و خطای مواجهه‌ها و نتایج Bias and error of exposures and outcomes

• چگونه مواجهه بیمار با بیماری یا درمان ممکن است اشتباه طبقه‌بندی شود How a patient's exposure might be misclassified

• چگونه نتیجه درمان بیمار ممکن است اشتباه طبقه‌بندی شود How a patient's outcome could be misclassified

• داده‌های پرونده الکترونیک پزشکی Electronic medical record data

• داده‌های ادعای بیمه Claims data

• داروسازی Pharmacy

• مجموعه‌داده‌های نظارتی و ثبت‌های پزشکی Surveillance datasets and Registries

• مجموعه‌داده‌های سلامت جمعیت Population health data sets

• چارچوبی برای ارزیابی مفید بودن یک منبع داده A framework to assess if a data source is useful

• جمع‌بندی Wrap Up

نمایش زمان و زمان‌بندی رویدادها برای داده‌کاوی بالینی Representing time, and timing of events, for clinical data mining

• مقدمه Introduction

• زمان، خطوط زمانی، مقیاس‌های زمانی و نمایش‌های زمان Time, timelines, timescales and representations of time

• مقیاس زمانی: انتخاب واحدهای زمانی مرتبط Timescale: Choosing the relevant units of time

• عواملی که بر مقیاس زمانی تأثیر می‌گذارند What affects the timescale

• نمایش زمان Representation of time

• داده‌های سری زمانی و غیرسری زمانی Time series and non-time series data

• ترتیب رویدادها Order of events

• نمایش‌های ضمنی زمان Implicit representations of time

• روش‌های مختلف دسته‌بندی داده‌ها در بازه‌های زمانی (Bins) Different ways to put data in bins

• زمان‌بندی مواجهه‌ها و نتایج Timing of exposures and outcomes

• فرآیندهای بالینی غیرایستا (Non-stationary) هستند Clinical processes are non-stationary

• جمع‌بندی Wrap Up

ایجاد مجموعه‌داده‌های آماده برای تحلیل از روی خط زمانی بیمار Creating analysis ready datasets from patient timelines

• تبدیل داده‌های بالینی به فرمتی قابل تحلیل Turning clinical data into something you can analyze

• تعریف واحد تحلیل Defining the unit of analysis

• استفاده از ویژگی‌ها و حضور ویژگی‌ها Using features and the presence of features

• چگونه ویژگی‌ها را از منابع ساختاریافته بسازیم How to create features from structured sources

• استانداردسازی ویژگی‌ها Standardizing features

• مدیریت ویژگی‌های بسیار زیاد Dealing with too many features

• ریشه‌های مقادیر گم‌شده (Missing Values) The origins of missing values

• مدیریت مقادیر گم‌شده Dealing with missing values

• توصیه‌های خلاصه برای مقادیر گم‌شده Summary recommendations for missing values

• ساخت ویژگی‌های جدید Constructing new features

• مثال‌هایی از ویژگی‌های مهندسی شده Examples of engineered features

• چه زمانی باید به ویژگی‌های مهندسی شده فکر کنیم When to consider engineered features

• نکات اصلی در مورد ایجاد مجموعه‌داده‌های آماده برای تحلیل Main points about creating analysis ready datasets

• گراف‌های دانش ساختاریافته Structured knowledge graphs

• دقیقاً چه چیزی در یک گراف دانش قرار دارد So what exactly is in a knowledge graph

• گراف‌های دانش مهم What are important knowledge graphs

• چگونه انتخاب کنیم کدام گراف دانش را استفاده کنیم How to choose which knowledge graph to use

• جمع‌بندی Wrap Up

مدیریت داده‌های بدون ساختار بهداشتی: متن، تصاویر و سیگنال‌ها Handling unstructured healthcare data: text, images, signals

• مقدمه‌ای بر داده‌های بدون ساختار Introduction to unstructured data

• متن‌های بالینی چیستند What is clinical text

• ارزش متن‌های بالینی The value of clinical text

• چه چیزی مدیریت متن‌های بالینی را دشوار می‌کند What makes clinical text difficult to handle

• حریم خصوصی و حذف شناسه‌ها (De-identification) Privacy and de-identification

• مبانی پردازش زبان طبیعی (NLP) A primer on Natural Language Processing

• رویکرد کاربردی برای پردازش متن‌های بالینی Practical approach to processing clinical text

• خلاصه متن‌های بالینی Summary - Clinical text

• مرور کلی و اهداف تصویربرداری پزشکی Overview and goals of medical imaging

• چرا تصاویر مهم هستند؟ Why are images important?

• تصاویر چیستند؟ What are images?

• یک فرآیند مدیریت تصویر معمولی A typical image management process

• خلاصه تصاویر Summary - Images

• مرور کلی سیگنال‌های زیست‌پزشکی Overview of biomedical signals

• چرا سیگنال‌ها مهم هستند؟ Why are signals important?

• سیگنال‌ها چیستند؟ What are signals?

• مشکلات اصلی در استفاده از سیگنال‌ها چیست What are the major issues with using signals?

• خلاصه سیگنال‌ها Summary - Signals

• جمع‌بندی Wrap Up

ترکیب قطعات: فنوتایپینگ الکترونیکی Putting the pieces together: Electronic phenotyping

• مقدمه‌ای بر فنوتایپینگ الکترونیکی Introduction to electronic phenotyping

• چالش‌های فنوتایپینگ الکترونیکی Challenges in electronic phenotyping

• تعیین ویژگی‌های یک فنوتایپ الکترونیکی Specifying an electronic phenotype

• دو رویکرد به فنوتایپینگ Two approaches to phenotyping

• فنوتایپینگ الکترونیکی مبتنی بر قانون Rule-based electronic phenotyping

• مثال‌هایی از تعاریف فنوتایپ الکترونیکی مبتنی بر قانون Examples of rule based electronic phenotype definitions

• ساخت یک تعریف فنوتایپ مبتنی بر قانون Constructing a rule based phenotype definition

• فنوتایپینگ احتمالی Probabilistic phenotyping

• رویکردها برای ایجاد یک تعریف فنوتایپ احتمالی Approaches for creating a probabilistic phenotype definition

• نرم‌افزارهای مورد استفاده برای تعاریف فنوتایپ احتمالی Software for probabilistic phenotype definitions

• جمع‌بندی Wrap Up

اخلاق Ethics

• مقدمه‌ای بر اخلاق در پژوهش و هوش مصنوعی Introduction to Research Ethics and AI

• گزارش بل‌مونت: چارچوبی برای اخلاق در پژوهش The Belmont Report: A Framework for Research Ethics

• مسائل اخلاقی در منابع داده برای هوش مصنوعی Ethical Issues in Data sources for AI

• استفاده‌های ثانویه از داده‌ها Secondary Uses of Data

• بازگرداندن نتایج Return of Results

• هوش مصنوعی و سیستم سلامت یادگیرنده AI and The Learning Health System

• خلاصه اخلاق Ethics Summary

جمع‌بندی دوره Course Conclusion

• جمع‌بندی نهایی Conclusion