آموزش به‌کارگیری علوم داده در گزارش‌دهی بالینی - آخرین آپدیت

به‌کارگیری علوم داده در گزارش‌دهی بالینی Making Data Science work for clinical reporting

• به‌کارگیری علوم داده در گزارش‌دهی بالینی Making data science work for clinical reporting

• مقدمه‌ای بر کارآزمایی‌های بالینی Introduction to Clinical Trials

• چرا از علوم داده در گزارش‌دهی بالینی استفاده کنیم؟ Why use data science in clinical reporting?

• مرور بخش Module Review

بار مسئولیت بی‌نقص بودن و شفافیت The burden of being faultless and transparent

• مقدمه Introduction

• انگیزه و هدف Motivation

• ساختار بخش Module Structure

• شفافیت در مقابل بازتولیدپذیری Transparency vs. Reproducibility

• مقدمه Introduction

• استانداردهای CDISC CDISC Standards

• دیکشنری‌ها Dictionaries

• استانداردهای کدنویسی Coding Standards

• توده‌های کاغذ (مجازی) Reams of (Virtual) Paper

• تحولات صنعت Industry Developments

• مقدمه Introduction

• دستورالعمل‌های استاندارد عملیاتی (SOPs) Standard Operating Procedures (SOPs)

• تایید صلاحیت و اعتبارسنجی Qualification & Validation

• کنترل کیفیت داده‌ها Data Quality Control

• کنترل کیفیت برنامه‌های تحلیل Quality Control of Analysis Programs

• توده‌های کاغذ (مجازی) Reams of (Virtual) Paper

• توسعه صنعت Industry Development

• مقدمه Introduction

• نام‌مستعارسازی و ناشناس‌سازی Pseudonymization & Anonymization

• شرکت‌های FSP و CRO FSPs & CROs

• آشکارسازی (Unblinding) Unblinding

• توده‌های کاغذ (مجازی) Reams of (Virtual) Paper

• مرور بخش Module Review

به‌کارگیری متدهای DevOps و تفکر چابک در گزارش‌دهی بالینی Bringing DevOps practices and agile mindset to clinical reporting

• مقدمه‌ای بر بخش ۲ Introduction to Module 2

• علوم داده به عنوان روشی جدید برای تفکر Data Science as a new way of thinking

• مقدمه‌ای بر متدولوژی چابک (Agile) Introduction to agile

• متدهای DevOps DevOps practices

• ذهنیت علوم داده The Data Science mindset

• شروع به کار Getting started

• پروژه‌های آزمایشی و اجرای چابک Pilots and doing agile

• مقیاس‌پذیری Scaling up

• خلاصه بخش ۲ Module 2 Recap

کنترل نسخه و جریان‌های Git برای گزارش‌دهی بالینی بازتولیدپذیر Version control and git flows for reproducible clinical reporting

• کنترل نسخه و جریان‌های git برای گزارش‌دهی بالینی بازتولیدپذیر Version control and git flows for reproducible clinical reporting

• مقدمه درس ۱ Lesson 1 Introduction

• چیستی و چرایی کنترل نسخه The whats and whys of version control

• گیت (Git) چیست؟ What is Git?

• ایده‌های کلیدی در Git Key ideas in Git

• همکاری از طریق Github Collaboration via Github

• مقدمه درس ۲ Introduction to Lesson 2

• جریان‌های کاری در Git Workflows in Git

• جریان گیت (Git Flow) Git Flow

• انتخاب جریان‌های کاری برای کاربردهای بالینی Selecting workflows for clinical use

• استفاده از Git برای متدولوژی چابک Using Git for Agile

• مقدمه درس ۳ Introduction to lesson 3

• استفاده از Git در RStudio Using Git in RStudio

• دستیابی به بازتولیدپذیری واقعی در R Being truly reproducible in R

• پروژه‌های با ساختار مناسب Well Structured Projects

• کتابخانه‌های R R Libraries

• نسخه R R Version

• مرور بخش Module Review

ایجاد کد بازاستفاده و مستحکم در گزارش‌دهی بالینی — فراخوانی برای InnerSourcing Making code reusable and robust in clinical reporting — a call for InnerSourcing

• مقدمه‌ای بر بخش ۴ Introduction to Module 4

• InnerSourcing چیست؟ What is an InnerSourcing?

• چه زمانی از OpenSource استفاده کنیم؟ When to OpenSource?

• چرا باید از بسته‌های R برای توسعه کد استفاده کنیم؟ Why should we use R packages for code development?

• انواع مختلف بسته‌های R Different types of R packages

• محیط توسعه بسته‌های R Environment for R package development

• ساختار و محتوای بسته R R package structure and content

• مستندات بسته R R package documentation

• کد تمیز (Clean Code) Clean code

• بوی کد (Code Smells) Code smells

• جریان کاری توسعه Development workflow

• پیش از انتشار Before release

• نوشتن نرم‌افزارهای آماری برای اجرای مستحکم متدهای پیچیده Writing statistical software that can robustly implement complex methods

• استفاده از CI/CD به عنوان حلقه بازخورد در توسعه بسته‌های R CI/CD as a feedback loop for in-development R packages

• کالبدشکافی جریان کاری CI/CD برای یک بسته R Anatomy of a CI/CD workflow for an R package

• مرور بخش Module Review

ارزیابی و مدیریت ریسک Assessing and managing risk

• مقدمه‌ای بر ریسک در کد منبع Introduction to risk in your codebase

• چرا باید کیفیت بسته‌ها را در نظر بگیریم؟ Why should we consider package quality?

• بررسی جامعه‌های پشت پروژه‌های متن‌باز Considering the communities behind Open Source projects

• ارزیابی پیاده‌سازی متدهای آماری پیچیده در بسته‌های مورد استفاده Asessing the implementation of complex statistical methods in a package you use

• چه ابزارها و رویکردهایی به ارزیابی و درک ریسک در بسته‌های R کمک می‌کنند؟ What tools and approaches can help to assess and understand risk in R packages I use?

نتیجه‌گیری Conclusion

• نتیجه‌گیری Conclusion