آموزش بیگ دیتا، ژنتیک و پزشکی - آخرین آپدیت

ژن‌ها و داده‌ها Genes and Data

• معرفی دوره Introduction to the Course

• معرفی ماژول Introduction to Module

• DNA و ژن‌ها DNA and Genes

• RNA و پروتئین‌ها RNA and Proteins

• فرآیند رونویسی Transcription Process

• انیمیشن رونویسی Transcription Animation

• فرآیند ترجمه Translation Process

• انیمیشن ترجمه Translation Animation

• داده‌ها، متغیرها و مجموعه‌داده‌های کلان Data, Variables, and Big Datasets

• کار با cBioPortal: تحلیل داده‌های ژنتیکی Working with cBioPortal - Genetic Data Analysis

• کار با cBioPortal: شبکه‌های ژنی Working with cBioPortal - Gene Networks

آماده‌سازی مجموعه‌داده‌ها برای تحلیل Preparing Datasets for Analysis

• معرفی ماژول Introduction to Module

• مجموعه‌داده‌ها و فایل‌ها Datasets and Files

• منابع داده Data Sources

• اهمیت پیش‌پردازش داده‌ها Importance of Data Preprocessing

• وظایف پیش‌پردازش داده‌ها Data Preprocessing Tasks

• جایگزینی مقادیر گم‌شده Replacing Missing Values

• نرمال‌سازی داده‌ها Data Normalization

• گسسته‌سازی داده‌ها Data Discretization

• انتخاب ویژگی Feature Selection

• نمونه‌برداری از داده‌ها Data Sampling

• اصول R Principles of R

• زبان برنامه‌نویسی R R Language

• مبانی ژوپیتر نوت‌بوک Jupyter Notebooks 101

یافتن ژن‌های با بیان متفاوت Finding Differentially Expressed Genes

• معرفی ماژول Introduction to Module

• مروری بر روش‌های انتخاب ویژگی Overview of Feature Selection Methods

• روش‌های فیلتر (Filter Methods) Filter Methods

• روش‌های پوششی (Wrapper Methods) Wrapper Methods

• طرح‌های ارزیابی Evaluation Schemes

• انتخاب ژن‌های با بیان متفاوت Selecting Differentially Expressed Genes

• نقشه‌های حرارتی (Heatmaps) Heatmaps

• اسکریپت‌های R برای انتخاب ویژگی R Scripts for Feature Selection

• مبانی ژوپیتر نوت‌بوک Jupyter Notebooks 101

پیش‌بینی بیماری‌ها از روی ژن‌ها Predicting Diseases from Genes

• معرفی ماژول Introduction to Module

• مروری بر روش‌های طبقه‌بندی و پیش‌بینی Overview of Classification and Prediction Methods

• روش‌های طبقه‌بندی بر اساس شباهت (Analogy) Classification Methods Based on Analogy

• روش‌های طبقه‌بندی بر اساس قوانین Classification Methods Based on Rules

• روش‌های طبقه‌بندی بر اساس شبکه‌های عصبی Classification Methods Based on Neural Networks

• روش‌های طبقه‌بندی بر اساس آمار Classification Methods Based on Statistics

• روش‌های طبقه‌بندی بر اساس احتمالات Classification Methods Based on Probabilities

• روش‌های پیش‌بینی Prediction Methods

• طرح‌های ارزیابی Evaluation Schemes

• گردش کار پیش‌بینی Prediction Workflow

• اسکریپت‌های R برای پیش‌بینی R Scripts for Prediction

• مبانی ژوپیتر نوت‌بوک Jupyter Notebooks 101

تعیین تغییرات ژنی Determining Gene Alterations

• معرفی ماژول Introduction to Module

• مروری بر تغییرات ژنی Overview of Gene Alterations

• جهش‌های ژنتیکی Genetic Mutations

• یافتن جهش‌های ژنتیکی Finding Genetic Mutations

• متیلاسیون Methylation

• تغییرات تعداد کپی (CNA) Copy Number Alterations

• تغییرات ژنومیک و بیان ژن Genomic Alterations and Gene Expressions

• اسکریپت‌های R برای تغییرات ژنی R Scripts for Gene Alterations

• مبانی ژوپیتر نوت‌بوک Jupyter Notebooks 101

خوشه‌بندی و تحلیل مسیر Clustering and Pathway Analysis

• معرفی ماژول Introduction to Module

• مروری بر روش‌های خوشه‌بندی Overview of Clustering Methods

• ارزیابی شباهت Similarity Assessment

• خوشه‌بندی با KMeans Clustering with KMeans

• خوشه‌بندی مبتنی بر چگالی Density Based Clustering

• خوشه‌بندی سلسله‌مراتبی Hierarchical Clustering

• تحلیل مسیر (Pathway Analysis) Pathway Analysis

• کشف مسیر Pathway Discovery

• بصری‌سازی مسیر Pathway Visualization

• اسکریپت‌های R برای خوشه‌بندی و تحلیل مسیر R Scripts for Clustering and Pathway Analysis

• مبانی ژوپیتر نوت‌بوک Jupyter Notebooks 101

• جمع‌بندی و نکات پایانی Concluding Remarks