لطفا جهت اطلاع از آخرین دوره ها و اخبار سایت در
کانال تلگرام
عضو شوید.
آموزش علم دادههای ژنومیک و خوشهبندی (بیوانفورماتیک ۵)
- آخرین آپدیت
دانلود Genomic Data Science and Clustering (Bioinformatics V)
نکته:
ممکن هست محتوای این صفحه بروز نباشد ولی دانلود دوره آخرین آپدیت می باشد.
نمونه ویدیوها:
توضیحات دوره:
چگونه متوجه شویم کدام ژنها فرآیندهای مختلف سلولی را هدایت میکنند؟ انسانها چگونه از آفریقا مهاجرت کرده و در سراسر جهان پخش شدند؟ در این دوره خواهیم دید که این دو پرسش به ظاهر متفاوت را میتوان با استفاده از تکنیکهای مشابه الگوریتمی و یادگیری ماشین، که از مسئله کلی تقسیم نقاط داده به خوشههای مجزا نشأت میگیرند، پاسخ داد.
در نیمه اول دوره، الگوریتمهای خوشهبندی گروهی از اشیاء را بر اساس شباهت آنها معرفی میکنیم که یک مسئله کلاسیک در علم داده است و بررسی خواهیم کرد که چگونه این الگوریتمها را میتوان روی دادههای بیان ژن اعمال کرد.
در نیمه دوم دوره، ابزار کلاسیک دیگری در علم داده به نام تحلیل مؤلفههای اصلی (PCA) را معرفی میکنیم که میتواند برای پیشپردازش دادههای چندبعدی قبل از خوشهبندی استفاده شود تا تعداد ابعاد را بدون از دست دادن «سیگنال» اصلی دادهها، به شدت کاهش دهد.
در نهایت، یاد خواهید گرفت که چگونه از ابزارهای نرمافزاری محبوب بیوانفورماتیک برای حل یک مسئله واقعی در خوشهبندی استفاده کنید.
سرفصل ها و درس ها
هفته اول: مقدمهای بر الگوریتمهای خوشهبندی
Week 1: Introduction to Clustering Algorithms
مشاهده ویدیو معرفی جذاب دوره
(Check Out Our Wacky Course Intro Video!)
کدام ژنهای مخمر مسئول شرابسازی هستند؟
Which Yeast Genes are Responsible for Wine Making?
ماتریسهای بیان ژن
Gene Expression Matrices
خوشهبندی به عنوان یک مسئله بهینهسازی
Clustering as an Optimization Problem
الگوریتم لوید برای خوشهبندی k-Means
The Lloyd Algorithm for k-Means Clustering
نمایش نظرات