آموزش تکامل مولکولی (بیوانفورماتیک ۴) - آخرین آپدیت

سرفصل ها و درس ها

هفته اول: مقدمه‌ای بر ساخت درخت تکاملی Week 1: Introduction to Evolutionary Tree Construction

• ویدئوی معرفی جذاب دوره را تماشا کنید (Check Out Our Wacky Course Intro Video!)

• سریع‌ترین شیوع The Fastest Outbreak

• تبدیل ماتریس‌های فاصله به درخت‌های تکاملی Transforming Distance Matrices into Evolutionary Trees

• به سوی الگوریتمی برای ساخت فیلوژنی بر پایه فاصله Toward an Algorithm for Distance-Based Phylogeny Construction

• فیلوژنی افزودنی Additive Phylogeny

هفته دوم: الگوریتم‌های بیشتر برای ساخت درخت‌ها از ماتریس‌های فاصله Week 2: More Algorithms for Constructing Trees from Distance Matrices

• استفاده از کمترین مربعات برای ساخت فیلوژنی‌های مبتنی بر فاصله Using Least Squares to Construct Distance-Based Phylogenies

• درخت‌های اولترامتریک Ultrametric Trees

• الگوریتم اتصال همسایگی (Neighbor Joining) The Neighbor-Joining Algorithm

هفته سوم: ساخت درخت‌های تکاملی بر اساس ویژگی‌ها Week 3: Constructing Evolutionary Trees from Characters

• بازسازی درخت بر اساس ویژگی‌ها Character-Based Tree Reconstruction

• الگوریتم پارسیمونی کوچک The Small Parsimony Algorithm

• الگوریتم پارسیمونی بزرگ The Large Parsimony Algorithm

• بازسازی درخت تکاملی در عصر مدرن Evolutionary Tree Reconstruction in the Modern Era

هفته چهارم Week 4

• تلاقی دیرینه‌شناسی و محاسبات Paleontology Meets Computing

• رمزگشایی از یک طیف ایده‌آل Decoding an Ideal Spectrum

• از طیف‌های ایده‌آل به طیف‌های واقعی From Ideal to Real Spectra

• توالی‌یابی پپتیدها Peptide Sequencing

هفته پنجم: حل معمای پپتیدهای تی‌رکس Week 5: Resolving the T. rex Peptides Mystery?

• شناسایی پپتیدها Peptide Identification

• دیکشنری‌های طیفی Spectral Dictionaries

• معمای هموگلوبین شترمرغ The Ostrich Hemoglobin Riddle

• جستجو برای تغییرات پس از ترجمه Searching for Post-Translational Modifications

• الگوریتم تراز طیفی Spectral Alignment Algorithm

هفته ششم: چالش کاربردی بیوانفورماتیک Week 6: Bioinformatics Application Challenge