آموزش تراز توالی ساده برای تحقیق: راهنمای سریع

سرفصل ها و درس ها

مقدمه ای بر همترازی توالی Introduction to sequence alignment

• معرفی Introduction

• تراز توالی چیست و چرا اهمیت دارد؟ What is sequence alignment and why is it important?

• مروری بر انواع مختلف هم ترازی دنباله Overview of different types of sequence alignment

• مفاهیم و اصطلاحات اساسی Basic concepts and terminology

الگوریتم‌ها و نرم‌افزارهای هم‌ترازی توالی Algorithms and software for sequence alignment

• مروری بر الگوریتم‌های مختلف مورد استفاده برای هم‌ترازی توالی Overview of different algorithms used for sequence alignment

• الگوریتم Needleman-Wunsch در پایتون Needleman-Wunsch Algorithm in Python

• الگوریتم واترمن اسمیت در پایتون Smith waterman Algorithm in Python

• مقدمه ای بر ابزارهای نرم افزاری محبوب برای تراز کردن توالی Introduction to popular software tools for sequence alignment

• با استفاده از ClustaW Using ClustaW

• استفاده از MUSCLE Using MUSCLE

• استفاده از تی کافی Using T-Coffee

• با استفاده از MAFFT Using the MAFFT

• تراز از طریق MEGA 7 Alignment Via MEGA 7

کاربردهای تراز توالی Applications of Sequence Alignment

• کاربردهای تراز توالی Applications of Sequence Alignment

• شناسایی دامنه های حفاظت شده Identification of Conserved Domains

• تشخیص توالی های همولوگ Detection of Homologous Sequences

موضوعات پیشرفته در چینش ترتیبی Advanced topics in sequence alignment

• تراز چند توالی Multiple sequence alignment

• هم ترازی سازه Structural alignment

• پیش بینی ژن Gene prediction