آموزش نوروهکینگ (Neurohacking) با زبان R - آخرین آپدیت

مقدمه Introduction

• معرفی تیم Meet the Team

• مقدمه‌ای بر دوره Introduction

• MRI ساختاری و زبان R Structural MRI and R

تصویربرداری عصبی: فرمت‌ها و بصری‌سازی Neuroimaging: Formats and Visualization

• ساختارهای داده و عملیات Data Structures and Operations

• فرمت NIfTI The NIfTI Format

• بصری‌سازی پایه ۱ Basic Visualization 1

• بصری‌سازی پایه ۲ Basic Visualization 2

• مدیریت پایه داده‌ها Basic Data Manipulation

• تبدیلات و هموارسازی Transformations and Smoothing

• کنتراست‌های پایه MRI Basic MRI Contrasts

پردازش تصویر Image Processing

• پیش‌پردازش: یک نمای کلی Preprocessing: An Overview

• ثبت تصاویر (Registration) Registration

• پیش‌نیازهای سیستم برای fslr fslr: System Requirements

• اصلاح میدان بایاس با استفاده از fslr Bias Field Correction Using fslr

• استخراج مغز با استفاده از fslr Brain Extraction using fslr

• ثبت تصاویر با استفاده از fslr Image Registration Using fslr

• نصب ANTsR Installing ANTsR

• مدیریت پایه داده‌ها با ANTsR Basic Data Manipulation with ANTsR

• پیش‌پردازش با ANTsR Pre-Processing with ANTSR

پردازش پیشرفته تصویر Extended Image Processing

• پردازش پیشرفته تصاویر مغزی Advanced Brain Image Processing

• هم‌ثبتی (Co-Registration) با fslr Co-Registration using fslr

• هم‌ثبتی (Co-Registration) با ANTsR Co-Registration using ANTsR

• توابع Wrapper برای خط لوله‌های پردازشی Wrapper Functions for Processing Pipelines

• هم‌ثبتی تصاویر T1 در جلسات مختلف Across-Visit Co-Registration of T1 Images

• ثبت صلب (Rigid) نسبت به قالب استاندارد Rigid Registration to a Template

• ثبت آفین (Affine) تصویر T1 نسبت به قالب Affine Registration of T1 to Template

• ثبت غیرخطی (Nonlinear) تصویر T1 نسبت به قالب Nonlinear Registration of T1 to Template

• استخراج اطلاعات آناتومیک ROI از ثبت غیرخطی Getting ROI Anatomic Information from Non-Linear Registration

• بخش‌بندی در سطح بافتی (Tissue Segmentation) Tissue-Level Segmentation

• پاپایار: مشاهده تعاملی تصاویر در R Papayar: Interactively Viewing Images in R