آموزش راهنمای جامع پایگاه های داده در بیوانفورماتیک

سرفصل ها و درس ها

معرفی Introduction

• معرفی Introduction

• درک اهمیت پایگاه های داده در بیوانفورماتیک Understanding the Significance of Databases in Bioinformatics

• مروری بر انواع مختلف پایگاه های داده بیوانفورماتیک Overview of Different Types of Bioinformatics Databases

• نقش پایگاه های داده در تحقیقات و تجزیه و تحلیل بیولوژیکی Role of Databases in Biological Research and Analysis

• برخی از چیزهایی که باید بدانید Some things to know

NCBI NCBI

• مقدمه ای بر NCBI Introduction to NCBI

• فرم بازیابی توالی NCBI Sequence Retrieval form NCBI

• BLAST، PubChem، PubMed و PubMed Central BLAST, PubChem, PubMed and PubMed Central

• پایگاه داده SRA و پایگاه داده GEO SRA database and GEO databases

• dbSNP، Book Shelf و CDD dbSNP, BookShelf and CDD

UniProt UniProt

• مقدمه ای بر UniProt Introduction to UniProt

• جستجو از طریق UniProt Searching through UniProt

• صفحه پروتئین UniProt UniProt Protein Page

• پایگاه داده UniProt UniProt Database

• بازیابی اطلاعات از UniProt Data Retrieval from UniProt

• انفجار BLAST

• UniProt Align، پپتید جستجو و نقشه برداری ID UniProt Align, Peptide Search and ID Mapping

بانک اطلاعات پروتئین (PDB) Protein Data Bank (PDB)

• مقدمه ای بر PDB Introduction to PDB

• پیمایش از طریق PDB Navigating Through PDB

• جستجو در PDB Searching on PDB

• پایگاه های داده PDB Databases of PDB

• تراز ساختار در PDB Structure Alignment in PDB

• PDB و BLAST PDB and BLAST

KEGG - پایگاه داده مسیر یکپارچه KEGG - Integrated Pathway Database

• مروری بر پایگاه داده KEGG Overview of KEGG Database

• پیمایش از طریق KEGG Navigating Through KEGG

• جستجو در KEGG Searching on KEGG

• پایگاه های داده KEGG KEGG Databases

• ابزارهای KEGG KEGG Tools

ExPASY - پایگاه داده ابزارهای بیوانفورماتیک ExPASY - Bioinformatics Tools Databases

• بررسی اجمالی ExpASY Overview of ExPASY

• ابزارهای ExPASY Genes & Genomes ExPASY Genes & Genomes Tools

• ExPASY Proteins & Proteomes Tools ExPASY Proteins & Proteomes Tools

• ExPASY Evolution & Phylogeny Tools ExPASY Evolution & Phylogeny Tools

• ابزارهای زیست شناسی ساختاری ExPASY ExPASY Structural Biology Tools

• ابزارهای زیست شناسی سیستم های ExPASY ExPASY Systems Biology Tools

• ابزارهای یادگیری ماشین و استخراج متن ExPASY ExPASY Text Mining & Machine Learning Tools

پایگاه های داده تخصصی و روندهای نوظهور Specialized Databases and Emerging Trends

• مقدمه ای بر پایگاه های داده تخصصی Introduction to Specialized Databases

• فلای بیس FlyBase

• پایگاه داده Galaxy Galaxy Database

• EcoCyc EcoCyc

• پایگاه داده ژنوم موش (RGD) Rat Genome Database (RGD)

• پروژه پایگاه داده ریبوزومی Ribosomal Database Project

• پایگاه داده توالی HIV HIV Sequence Database

• Rfam Rfam

• miRBase miRBase

تکنیک های بازیابی و تجزیه و تحلیل داده ها Data Retrieval and Analysis Techniques

• استراتژی های کارآمد بازیابی داده ها در میان پایگاه های داده Efficient Data Retrieval Strategies Across Databases

• تکنیک های تجزیه و تحلیل داده ها با استفاده از پایگاه های داده بیوانفورماتیک Data Analysis Techniques Using Bioinformatics Databases

• عیب یابی مشکلات رایج در پرس و جو در پایگاه داده Troubleshooting Common Issues in Database Querying

• خلاصه دوره Course Summary