آموزش پروژه نهایی بیوانفورماتیک گیاهی - آخرین آپدیت

دانلود Plant Bioinformatics Capstone

نکته: ممکن هست محتوای این صفحه بروز نباشد ولی دانلود دوره آخرین آپدیت می باشد.

نمونه ویدیوها: (صرفا برای مشاهده نمونه ویدیو، ممکن هست نیاز به شکن داشته باشید.)

توضیحات دوره: ۱۵ سال گذشته دوران هیجان‌انگیزی در زیست‌شناسی گیاهی بوده است. صدها ژنوم گیاهی توالی‌یابی شده‌اند، RNA-seq تحلیل پروفایل‌های بیان در سطح ترانسکریپتوم را ممکن ساخته و گسترش روش‌های مبتنی بر "seq-" اجازه داده است تا برهم‌کنش‌های پروتئین-پروتئین و پروتئین-DNA به صورت ارزان و با بازدهی بالا تعیین شوند. این مجموعه‌داده‌ها به نوبه خود به ما اجازه می‌دهند تا تنها با یک کلیک یا لمس، فرضیات علمی ایجاد کنیم. در دوره بیوانفورماتیک گیاهی در Coursera.org، ما ۳۳ ابزار آنلاین تخصصی گیاهی، از مرورگرهای ژنوم گرفته تا استخراج داده‌های ترانسکریپتومیک و تحلیل‌های پروموتر/شبکه و موارد دیگر را پوشش دادیم. در این پروژه نهایی (Capstone) بیوانفورماتیک گیاهی، از این ابزارها برای فرضیه‌سازی درباره نقش بیولوژیکی یک ژن با عملکرد ناشناخته استفاده خواهیم کرد و نتایج را در قالب یک گزارش آزمایشگاهی مکتوب خلاصه می‌کنیم. این دوره بخشی از تخصص بیوانفورماتیک گیاهی در کورسرا است که компетенسی‌ها و منابع اصلی بیوانفورماتیک مانند Genbank NCBI، Blast، تراز توالی‌های متعدد و فیلوژنتیک را در «روش‌های بیوانفورماتیک ۱» معرفی می‌کند. سپس در «روش‌های بیوانفورماتیک ۲» به بررسی برهم‌کنش‌های پروتئین-پروتئین، بیوانفورماتیک ساختاری و تحلیل RNA-seq می‌پردازد، علاوه بر مفاهیم و ابزارهای تخصصی گیاهی که در دوره بیوانفورماتیک گیاهی و پروژه نهایی آن ارائه شده است. این دوره/پروژه با حمایت مالی صندوق ابتکارات دوره‌های باز دانشکده هنر و علوم دانشگاه تورنتو توسعه یافته و توسط ادی استبان، ویل هیکوپ و نیکولاس پرووارت اجرا شده است. آشر پاشا نیز برنامه تصادفی‌ساز شناسه ژن (gene ID randomizer) را طراحی کرده است.

سرفصل ها و درس ها