آموزش بیوانفورماتیک را از ابتدا بیاموزید (تئوری و عملی)

Learn Bioinformatics From Scratch (Theory & Practical)

نکته: آخرین آپدیت رو دریافت میکنید حتی اگر این محتوا بروز نباشد.
نمونه ویدیوها:
توضیحات دوره: بهترین دوره بیوانفورماتیک برای دانشجویان، دانشگاهیان و متخصصان صنعت برای یادگیری بیوانفورماتیک و داده های بیولوژیکی شما تئوری پایه و نمایش عملی ابزارهای بیوانفورماتیک را یاد خواهید گرفت شما یاد خواهید گرفت که چگونه پایگاه داده ها را کاوش کنید و توالی ها را تراز کنید (توالی های دو به دو و چندگانه) تئوری و عملی را یاد خواهید گرفت. برای پیش‌بینی ژن‌ها و عناصر تنظیم‌کننده آن‌ها درک خوبی در مورد مدل‌سازی همولوژی برای پیش‌بینی ساختار سه‌بعدی (تئوری و عملی) خواهید داشت. ) اتصال گیرنده-لیگاند و تجزیه و تحلیل داده های اتصال (عملی) درخت فیلوژنتیک (نظریه) ساخت درخت فیلوژنتیک در (عملی) این دوره پایه بیوانفورماتیک پایه بسیار قوی برای یادگیری آینده آنها خواهد گذاشت. ما ادعا می کنیم که تاکنون هیچ دوره جامعی مانند این در Udemy وجود ندارد. پیش نیازها: در تدریس آنلاین، جذب دانش آموزان همیشه سخت است. بنابراین ما این دوره را با توجه به روانشناسی دانش آموزان طراحی کرده ایم. معمولاً وقتی دانش‌آموزان در یک مفهوم پیچیده گیر می‌کنند علاقه خود را از دست می‌دهند، به همین دلیل سعی کردیم به راحتی و قابل درک از ساده به پیچیده حرکت کنیم. شما باید در مورد اصول اولیه ماکرو مولکول های بیولوژیکی بدانید. اگر جزئیات را نمی دانید نگران نباشید. به عنوان مثال، اگر نام DNA، RNA و پروتئین ها را شنیده اید و ایده اولیه ای در مورد نقش آنها در زندگی دارید، برای شما کافی است (اطلاعات سطح مدرسه). شما به این دوره خوش آمدید. در هر ماژول این دوره، ما از ابتدا شروع خواهیم کرد. ما فرض می کنیم که شما جز نام آنها چیزی در مورد DNA، RNA و پروتئین نمی دانید. امیدواریم این تکنیک درک بهتر مفاهیم هاردکور بیوانفورماتیک را برای شما آسان کند. این هیچ کدنویسی در این دوره نیست. اکثر ابزارهایی که ما استفاده خواهیم کرد به صورت آنلاین در دسترس هستند

این دوره آموزشی بیوانفورماتیک برای شما تغییر دهنده بازی است. در حال حاضر، انفجار داده های بیولوژیکی وجود دارد. شما باید مهارت های خود را برای مدیریت داده ها در عصر این داده های بیولوژیکی بزرگ توسعه دهید. مقابله با داده های بیولوژیکی بالا با استفاده از تکنیک های مرسوم از نظر انسانی غیرممکن است. اینجا بیوانفورماتیک می آید. بیوانفورماتیک در تقاطع زیست شناسی و علوم کامپیوتر قرار دارد. بدون این مهارت اولیه، ممکن است در پنج تا ده سال آینده در هیچ کجای پژوهش، دانشگاه و صنعت قرار نگیرید. با در نظر گرفتن این نیاز به زمان، ما در اینجا یک دوره آموزشی بیوانفورماتیک اولیه را برای شما آورده ایم.

این دوره شامل پنج ماژول است

(1) پایگاه داده

(2) تراز

(3) بیوانفورماتیک ژنومیک

(4) بیوانفورماتیک ساختاری

(5) بیوانفورماتیک تکاملی

این دوره ترکیبی منحصر به فرد از تئوری و عملی است. شما تئوری پایه را یاد می گیرید، سپس عملی انجام می دهید و پس از آن آزمون ها را امتحان می کنید تا دانش خود را بررسی کنید. در مجموع 93 سخنرانی در میان آنها وجود دارد، 19 آموزش عملی وجود دارد. علاوه بر این، 12 تکلیف و 5 آزمون در این دوره به همراه سخنرانی های تئوری وجود دارد. ما به شما اطمینان می دهیم که پس از گذراندن این دوره، دیدگاه شما برای داده های بیولوژیکی بسیار متفاوت خواهد بود. دانش‌آموزان اصول بیوانفورماتیک را یاد خواهند گرفت، از پایگاه‌های اطلاعاتی بیولوژیکی گرفته تا اتصال پروتئین-لیگاند.

امیدواریم این دوره ارزش پول و وقت شما را داشته باشد.



سرفصل ها و درس ها

ماژول 1 پایگاه های داده Module 1 Databases

  • تعریف پایگاه های داده Definition of Databases

  • طراحی پایگاه داده Database Design

  • کشف دانش Knowledge Discovery

  • پایگاه های بیولوژیکی Biological Databases

  • نکات کلیدی صفحه اصلی را در نظر بگیرید Take Home Key Points

  • عملی -1: پایگاه داده نوکلئوتیدی NCBI Practical -1: NCBI Nucleotide Database

  • عملی-2: بانک اطلاعات پروتئین (PDB) Practical-2: Protein Databank (PDB)

  • آزمون 1 Quiz 1

  • تکلیف 1 Assignment 1

ماژول 1 پایگاه های داده Module 1 Databases

ماژول 2 تراز توالی Module 2 Sequence Alignment

  • Sequence Alignment چیست؟ What is Sequence Alignment?

  • چند اصطلاح مهم Some Important Terms

  • انواع تراز توالی Types of Sequence Alignment

  • الگوریتم ها چیست؟ What is Algorithms?

  • الگوریتم ماتریس نقطه; چگونه کار می کند؟ Dot Matrix Algorithm; How Does It Work?

  • الگوریتم ماتریس نقطه; چگونه نتایج را تفسیر کنیم؟ Dot Matrix Algorithm; How to Interpret The Results?

  • الگوریتم ماتریس نقطه; شناسایی توالی های تکراری Dot Matrix Algorithm; Identification of Repeat Sequences

  • الگوریتم ماتریس نقطه; مزایا در مقابل معایب Dot Matrix Algorithm; Advantages Vs Disadvantages

  • عملی-3: DotMatcher برای مقایسه کیفی توالی Practical-3: DotMatcher for Qualitative Comparison of Sequence

  • تکلیف 2 Assignment 2

  • روش برنامه نویسی پویا: چگونه کار می کند؟ Dynamic Programming Method: How Does It Work?

  • چگونه ماتریس امتیازدهی را به تراز تبدیل کنیم؟ How to Transform Scoring Matrix to Alignment?

  • برنامه نویسی پویا؛ چند اصطلاح مهم برای درک Dynamic Programming; Some Important Terms to Understand

  • مقایسه بین DotMatrix و برنامه نویسی پویا Comparison Between DotMatrix and Dynamic Programming

  • عملی-4: همترازی توالی جفتی جهانی با استفاده از توالی های DNA Practical-4: Global Pairwise Sequence Alignment Using DNA Sequences

  • عملی-5: همترازی توالی دو به دو با استفاده از پروتئین Practical-5: Pairwise Sequence Alignment Using Protein

  • عملی-6: توالی زوجی محلی Practical-6: Local Pairwise Sequence

  • تکلیف 3 Assignment 3

  • مقدمه ای بر جستجوی پایگاه داده انفجار Introduction to Database Searching; BLAST

  • نوع الگوریتم ها Type of Algorithms

  • الگوریتم ورد چگونه کار می کند؟ (قسمت 1) How Does Word Algorithm Work? (Part-1)

  • الگوریتم ورد چگونه کار می کند؟ (قسمت 2) How Does Word Algorithm Work? (Part-2)

  • اصطلاحی مهم برای الگوریتم ورد A Important Term For Word Algorithm

  • مقادیر مهم آماری برای ارزیابی نتایج BLAST Important Statistical Values to Evaluate the BLAST Results

  • انواع مختلف BLAST مرتبط با پایگاه های داده NCBI Different Type of BLAST Associated with NCBI Databases

  • عملی -7: نحوه استفاده از برنامه BLAST Practical -7: How to Use BLAST Program

  • تکلیف 4 Assignment 4

  • اختیاری: نحوه استفاده از PSI-BLAST Optional: How to Use PSI-BLAST

  • تراز چند توالی; یک مقدمه Multiple Sequence Alignment; An Introduction

  • الگوریتم های تراز چند سکانسی Algorithms for Multiple Sequence Alignment

  • الگوریتم تراز توالی پیشرونده Progressive Sequence Alignment Algorithm

  • ابزارهایی برای تراز چند سکانسی Tools for Multiple Sequence Alignment

  • عملی -8: نحوه استفاده از CLUSTAL-W Practical -8: How to Use CLUSTAL-W

  • عملی -9: نحوه استفاده از T-COFFEE Practical -9: How to Use T-COFFEE

  • تکلیف 5 Assignment 5

  • آزمون 2 Quiz 2

ماژول 2 تراز توالی Module 2 Sequence Alignment

ماژول 3: بیوانفورماتیک ژنومیک Module 3: Genomic Bioinformatics

  • معرفی ماژول 3 Introduction of Module 3

  • DNA چیست؟ What is DNA?

  • DNA ما در کجا قرار دارد؟ Where Is Our DNA is Located?

  • نقش DNA چیست؟ What Is Role of DNA?

  • ژن چه چیزی دارد؟ What Does Gene Have?

  • الگوریتم های پیش بینی ژن-1 Algorithms for Gene Prediction-1

  • الگوریتم‌های پیش‌بینی ژن-2 Algorithms for Gene Prediction-2

  • GC-Bias و کد تست. یک نوع الگوریتم Ab-Initio GC-Bias and Test Code; An Ab-initio Type of Algorithm

  • معرفی مدل مارکوف (بخش اول) Introduction of Markov Model (Part-1)

  • معرفی مدل مارکوف (بخش دوم) Introduction of Markov Model (Part-2)

  • یادگیری ماشین و پیش‌بینی ژن Machine Learning and Gene Prediction

  • عملی-10: پیش بینی ژن پروکاریوتی Practical-10: Prediction of Prokaryotic Gene

  • عملی-10.1 پیش بینی عناصر تنظیم کننده پروکاریوتی Practical-10.1 Prediction of Prokaryotic Regulatory Elements

  • عملی-11 پیش بینی ژن یوکاریوتی Practical-11 Prediction of Eukaryotic Gene

  • تکلیف 6 Assignment 6

  • تکلیف 7 Assignment 7

  • امتحان 3 Quiz 3

ماژول 3: بیوانفورماتیک ژنومیک Module 3: Genomic Bioinformatics

ماژول 4: بیوانفورماتیک ساختاری Module 4: Structural Bioinformatics

  • معرفی ماژول 4 Introduction of Module 4

  • پروتئین چیست؟ (قسمت 1) What is Protein? (Part-1)

  • پروتئین چیست؟ (قسمت 2) What is Protein? (Part-2)

  • چند نکته مهم Some Important Points

  • نقش اسیدهای آمینه در ساختار سه بعدی Role of Amino Acids in 3D Structure

  • پیوند پپتیدی؛ ارتباط بین اسیدهای آمینه Peptide Bond; A link between Amino Acids

  • باند دوگانه در طرح پپتید باند و راماچاندران Double Bond like Character in Peptide Bond & Ramachandran Plot

  • نیروهای تثبیت کننده ساختار پروتئین Forces Stabilizing The Protein Structure

  • ساختارهای ثانویه پروتئین ها Secondary Structures of Proteins

  • عملی 13: تجسم ساختار پروتئین در Pymol (قسمت 1) Practical 13: Visualization of Protein Structure in Pymol (Part-1)

  • چرا پیش‌بینی ساختار پروتئین بسیار مهم است؟ Why Protein Structure Prediction is So Important?

  • الگوریتم های پیش بینی ساختار ثانویه پروتئین (قسمت 1) Protein Secondary Structure Prediction Algorithms (Part-1)

  • الگوریتم های پیش بینی ساختار ثانویه پروتئین (قسمت 2) Protein Secondary Structure Prediction Algorithms (Part-2)

  • عملی-15: پیش بینی ساختار ثانویه پروتئین کروی Practical-15: Prediction of Globular Protein Secondary Structure

  • تکلیف 8 Assignment 8

  • الگوریتم پیش‌بینی ساختار ثانویه پروتئین‌های گذرنده Algorithm for Secondary Structure Prediction of Transmembrane Proteins

  • عملی-16: پیش بینی ساختار ثانویه مارپیچ گذرنده Practical-16: Prediction of Transmembrane Helix Secondary Structure

  • تکلیف 9 Assignment 9

  • الگوریتم های پیش بینی ساختار سه بعدی 3D Structure Prediction Algorithms

  • الگوریتم مبتنی بر همسانی (بخش 1) Homology Based Algorithm (Part-1)

  • الگوریتم مبتنی بر همسانی (بخش 2) Homology Based Algorithm (Part-2)

  • الگوریتم مبتنی بر همسانی (بخش 3) Homology Based Algorithm (Part-3)

  • الگوریتم مبتنی بر همسانی (بخش 4) Homology Based Algorithm (Part-4)

  • اعتبارسنجی مدل و ترسیم الگوریتم مبتنی بر همسانی Model Validation & Draw back of Homology Based Algorithm

  • عملی-17: پیش بینی ساختار سه بعدی با استفاده از مدل سازی همسانی (Mdeller) Practical-17: Prediction of 3D structure Using Homology Modeling (Mdeller)

  • تکلیف 10 Assignment 10

  • الگوریتم نخ برای پیش بینی ساختار سه بعدی Threading Algorithm for 3D Structure Prediction

  • عملی-18: پیش بینی ساختار سه بعدی با استفاده از تکنیک نخ (I-TASSER) Practical-18: Prediction of 3D structure Using Threading Technique (I-TASSER)

  • تکلیف 11 Assignment 11

  • (اختیاری) Practical-18.1: استفاده از InterPro (Optional) Practical-18.1: Use of InterPro

  • (اختیاری) عملی-20: نحوه اجرای Docking به راحتی با استفاده از Vina (Optional) Practical-20: How to Perform Docking Easily Using Vina

  • (اختیاری) عملی-21: نحوه تجزیه و تحلیل داده های اتصال (Optional) Practical-21: How to Analyze the Docking Data

  • (اختیاری) عملی 3: پایگاه داده ZINC برای جستجوی مواد مخدر (Optional) Practical 3: ZINC Database for Drug Searching

  • آزمون 4 Quiz 4

  • (بسیار مهم) عملی نحوه استفاده از Alpha-Fold را یاد بگیرید (Very Important) Practical Learn How to Use Alpha-Fold

  • سرور GOR-IV دیگری را برای پیش بینی ساختار ثانویه به روز کنید Update Another GOR-IV Server for Secondary Structure Predictions

  • چگونه در Pymol تصاویر با کیفیت انتشار بسازیم؟ (خیلی مهم) How to Make Publication Quality Images In Pymol? (Very Important)

ماژول 4: بیوانفورماتیک ساختاری Module 4: Structural Bioinformatics

ماژول 5: بیوانفورماتیک تکاملی Module 5: Evolutionary Bioinformatics

  • تکامل و فیلوژنتیک چیست؟ What is Evolution and Phylogenetics

  • چند اصطلاح مهم برای درک درخت فیلوژنتیک Some Important Terms To Understand Phylogenetic Tree

  • انواع مختلف درختان فیلوژنتیک Different Type of Phylogenetic Trees

  • مراحل ساخت درخت فیلوژنتیک Steps To Construct Phylogenetic Tree

  • انتخاب نشانگر مولکولی برای ساخت درخت Selection of Molecular Marker for Tree Construction

  • تراز برای ساخت و ساز درخت Alignment for Tree Construction

  • انتخاب مدل تکاملی Evolutionary Model Selection

  • روش های ساخت درخت Methods To Construct Tree

  • اعتبارسنجی درخت با بوت استرپینگ Validation of Tree By Bootstrapping

  • عملی -19: ساخت درخت فیلوژنتیک Practical -19: Building Phylogenetic Tree

  • تکلیف 12 Assignment 12

  • آزمون 5 Quiz 5

ماژول 5: بیوانفورماتیک تکاملی Module 5: Evolutionary Bioinformatics

ماژول 6 (اختیاری) Module 6 (Optional)

  • عملی-22: نحوه نصب لینوکس در ویندوز برای تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک Practical-22: How to install Linux in Windows for Bioinformatics Analysis

  • عملی-23: نحوه نصب Gromacs در ویندوز Practical-23: How to Install Gromacs in Windows

  • عملی-24: نحوه دانلود Chemsketch Practical-24: How to Download Chemsketch

  • عملی-25: طراحی لیگاند و ساخت ساختار سه بعدی لیگاند Practical-25: Ligand Drawing and Making of Ligand 3D Structure

ماژول 6 (اختیاری) Module 6 (Optional)

به روز رسانی های اخیر در بیوانفورماتیک Recent Updates In Bioinformatics

  • به روز رسانی اخیر در مورد بانک اطلاعات پروتئین Recent Update About Protein Databank

به روز رسانی های اخیر در بیوانفورماتیک Recent Updates In Bioinformatics

نمایش نظرات

Udemy (یودمی)

یودمی یکی از بزرگ‌ترین پلتفرم‌های آموزشی آنلاین است که به میلیون‌ها کاربر در سراسر جهان امکان دسترسی به دوره‌های متنوع و کاربردی را فراهم می‌کند. این پلتفرم امکان آموزش در زمینه‌های مختلف از فناوری اطلاعات و برنامه‌نویسی گرفته تا زبان‌های خارجی، مدیریت، و هنر را به کاربران ارائه می‌دهد. با استفاده از یودمی، کاربران می‌توانند به صورت انعطاف‌پذیر و بهینه، مهارت‌های جدیدی را یاد بگیرند و خود را برای بازار کار آماده کنند.

یکی از ویژگی‌های برجسته یودمی، کیفیت بالای دوره‌ها و حضور استادان مجرب و با تجربه در هر حوزه است. این امر به کاربران اعتماد می‌دهد که در حال دریافت آموزش از منابع قابل اعتماد و معتبر هستند و می‌توانند به بهترین شکل ممکن از آموزش‌ها بهره ببرند. به طور خلاصه، یودمی به عنوان یکی از معتبرترین و موثرترین پلتفرم‌های آموزشی آنلاین، به افراد امکان می‌دهد تا به راحتی و با کیفیت، مهارت‌های مورد نیاز خود را ارتقا دهند و به دنبال رشد و پیشرفت شغلی خود باشند.

آموزش بیوانفورماتیک را از ابتدا بیاموزید (تئوری و عملی)
جزییات دوره
7 hours
99
Udemy (یودمی) Udemy (یودمی)
(آخرین آپدیت)
4,986
4.3 از 5
دارد
دارد
دارد
جهت دریافت آخرین اخبار و آپدیت ها در کانال تلگرام عضو شوید.

Google Chrome Browser

Internet Download Manager

Pot Player

Winrar

Muhammad Dujana Muhammad Dujana

دکتر محمد دوجانا